小蓝哥的知识荒原
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cowplot大小图嵌套

12345678ggdraw(p1 + theme_half_open(12)) + draw_plot(inset, .45, .45, .5, .5) + draw_plot_label( c("A", "B"), c(0, 0.45), c(1, 0.95), size = 12 ) 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang11
2022-03-31
生物信息学
#生物信息学

Ubuntu安装Bioperl模块

conda安装 1conda install -c bioconda perl-bioperl 查看bioperl的位置 1find ~/miniconda3/* -name "Seq.pm" 加入环境变量 1export PERL5LIB=/home/lixiang/miniconda3/pkgs/perl-bioperl-1.6.924-4/lib/perl5/site_perl/
2022-01-06
生物信息学
#生物信息学 #软件使用 #conda

WSL设置内存和线程数

从这里开始写正文 Windows + R 键,输入 %UserProfile% 并运行进入用户文件夹; 新建一个 {% label .wslconfig purple %} 文件,写入下面的内容: 1234[wsl2]memory=30Gswap=12Gprocessors=12 先关闭WSL: 1wsl --shutdown 再开启即可: 1wsl 💌lixiang117423
2021-11-25

植物免疫的转录调控网络

文献信息 Tsuda K, Somssich I E. Transcriptional networks in plant immunity[J]. New Phytologist, 2015, 206(3): 932-947. Summary除了大量的非生物胁迫外,植物还时刻都需要面对大量来自其周围环境中的病原菌。因此,在进化过程中的生存和繁殖能力在很大程度上依赖于对这些潜在威胁的有效感知、响
2023-02-25
文献阅读
#文献阅读

结构变异可视化工具SVbyEye

1 IntroductionGitHub地址文章链接 使用手册大佬Evan E. Eichler团队基于Miropeats开发的用于基因组结构变异可视化的工具SVbyEye,使用ggplot2绘图语法实现。 2 PAF格式输入文件需要输入的文件是PAF格式的,官方使用的比对软件是minimap2 (version >=2.24),但是任何sequence-to-sequence比对生成的结果
2025-05-09
生物信息学
#生物信息学

重测序分析脚本

重测序与群体遗传学 云南农业大学 云南生物资源保护与利用国家重点实验室 (李详 2019年12月31日) 软件安装该部分软件很难用conda直接安装,安装步骤比较特殊。
2021-11-23
生物信息学 - 群体遗传学 - Linux
#生物信息学 #Linux

Word交叉引用设置颜色为蓝色

参考知乎文章。 编辑一个新的宏: 12345678Sub CitingColor() For i = 1 To ActiveDocument.Fields.Count '遍历文档所有域 If Left(ActiveDocument.Fields(i).Code, 4) = " REF" Or Left(ActiveDocument.Fields(i).Code, 14) = "
2023-09-11
文献阅读
#文献阅读

mlr3随机森林

12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697989910010110210
2022-03-23
生物信息学
#生物信息学 #R语言 #机器学习

一种核心微生物的鉴定方法

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2023-06-08
生物信息学
#生物信息学

该选什么统计方法呢?

(来自Statistical Rethinking第二版)
2022-10-24
统计学
#统计学

Tools4You教程5:PCoA

关于PCoAPCoA(Principal Coordinates Analysis,主坐标分析)和PCA(点击查看PCA教程)一样是常见的数据降维方法,
2021-01-29
Tools4You
#Tools4You

遗传力的概念和计算

前言在作物育种过程中,通常会有多年多点的试验,这种试验通常叫做多环境试验(multi-environment trial,MET)。为了对MET进行准确的测量、最终实现实现MET的准确比较,育种学家通常会计算广义遗传力和狭义遗传力。这个文档主要有三个目的: 说清楚遗传力的概念; 展示使用合适的方法计算遗传力; 提供稳定的方法计算和比较田间试验的准确信。 遗传力的定义下图A中的公式表示表型可以用
2024-08-27
生物信息学
#生物信息学
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