小蓝哥的知识荒原
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UniProt数据库爬虫获取相关信息

最近在分析转录组,基因组是自己组装的,好多基因注释不到KEGG和GO这两个数据库,就索性先把基因蛋白blast到SwissProt数据库,然后得到比对的蛋白的ID,再经过筛选后再去看蛋白相关的GO term。但是,这么多基因我也不可能一个一个查啊,那就Python爬虫吧。
2021-04-18
Python
#Python

Ubuntu安装Aspera

2021-11-23
生物信息学
#生物信息学 #软件安装

fasta文件加标签

2021-12-10
生物信息学
#生物信息学 #Python #fasta文件

超算上使用Parabricks

2025-07-07
生物信息学
#生物信息学

记录安装Mambaforge遇到的坑

2023-12-12
生物信息学
#生物信息学

bismark过程中的一个小细节

2024-09-24

NCBI基因组ftp下载连接

2022-05-21
生物信息学
#生物信息学

ggplot2画箭头

突然有个用ggplot2画箭头的需求,So,搞它!
2020-12-16
R语言
#R语言

NMDS分析

NMDS(nonmetric multidimensional scaling,非度量多维尺度分析)是排序(ordination)分析一种。排序分析的目的在于寻找数据的连续性(也就是通过连续的排序轴来展示数据的主要趋势)。
2021-01-04
R语言
#R语言

安装hexo遇到的bug及解决方法

如果在运行hexo init和npm install报错的话,用 Node.js 自带的 Node.js command prompt 执行这两个命令就行了。 在cmd命令行中且切换目录:cd /d d:
2020-12-17
hexo
#hexo

代谢物鉴定函数

2024-06-12
生物信息学
#生物信息学

尿囊素保护番茄免受UV-C胁迫

编者注:2018年New Phytologist 上发表了一篇文章Kin recognition in rice (Oryza sativa) lines$^{[1]}$,在水稻根系分泌物中有一种关键的化合物:尿囊素(allantoin, AT)——可以作为水稻品种间亲缘识别的关键物质。 这篇文章主要讲的是AT在作物非生物胁迫上的效应。
2021-01-01
文献
#文献
1…678910…27

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