UniProt数据库爬虫获取相关信息 最近在分析转录组,基因组是自己组装的,好多基因注释不到KEGG和GO这两个数据库,就索性先把基因蛋白blast到SwissProt数据库,然后得到比对的蛋白的ID,再经过筛选后再去看蛋白相关的GO term。但是,这么多基因我也不可能一个一个查啊,那就Python爬虫吧。 2021-04-18 Python #Python
NMDS分析 NMDS(nonmetric multidimensional scaling,非度量多维尺度分析)是排序(ordination)分析一种。排序分析的目的在于寻找数据的连续性(也就是通过连续的排序轴来展示数据的主要趋势)。 2021-01-04 R语言 #R语言
安装hexo遇到的bug及解决方法 如果在运行hexo init和npm install报错的话,用 Node.js 自带的 Node.js command prompt 执行这两个命令就行了。 在cmd命令行中且切换目录:cd /d d: 2020-12-17 hexo #hexo
尿囊素保护番茄免受UV-C胁迫 编者注:2018年New Phytologist 上发表了一篇文章Kin recognition in rice (Oryza sativa) lines$^{[1]}$,在水稻根系分泌物中有一种关键的化合物:尿囊素(allantoin, AT)——可以作为水稻品种间亲缘识别的关键物质。 这篇文章主要讲的是AT在作物非生物胁迫上的效应。 2021-01-01 文献 #文献