Docker部署nextcloud修改配置文件 找到对应的文件修改即可: 1find /var -name "config.php" 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-01-17 生物信息学 #生物信息学
PCA提取变量的贡献度 1234567891011121314151617181920212223rm(list = ls())library(vegan)library(ggplot2)library(ggprism)library(FactoMineR)library(factoextra)data("iris")res.pca <- PCA(iris[, 1:4], graph = FALSE)contrib 2022-04-03 生物信息学 #生物信息学
葡萄Science文章基因组学和群体遗传学代码 参考文献 Dong Y, Duan S, Xia Q, et al. Dual domestications and origin of traits in grapevine evolution[J]. Science, 2023, 379(6635): 892-901. 基因组组装和注释12345678910111213141516171819202122232425262728293031 2025-01-07 生物信息学 #生物信息学
宏基因组学习笔记 分析策略以下三个图来自微信公众号[希研未来]。 基于reads 基于组装 基于Bin 软件安装常用的这些软件用Conda或者是mamba都很好处理,但是metaWRAP这个软件是真的难安装啊。踩坑多次终于安装上了: 1mamba create -y --name metawrap-env --channel ursky metawrap-mg=1.3.2 数据配置Che 2023-06-15 生物信息学 #生物信息学
生物信息学常用的分析方法和相应的软件及代码 基因组序列质控 trimmomatic:过滤低质量的reads 基因组大小估计基于k-mer的方法 KAT:k-mer提取和计数 GenomeScope:评估基因组大小 estimate_genome_size.pl:估计基因组大小 基因组组装Hi-Fi数据 Hifiasm:Hi-Fi数据组装 ONT数据 Canu:基因组组装 SMARTdenovo:将reads组装为contig 染色体 2025-09-20 生物信息学 #生物信息学
DNA甲基化数据分析流程 参考文献 Wilkinson S W, Hannan Parker A, Muench A, et al. Long-lasting memory of jasmonic acid-dependent immunity requires DNA demethylation and ARGONAUTE1[J]. Nature Plants, 2023: 1-15. 原始数据:点击查看 参考基因组E 2023-01-30 生物信息学 #生物信息学
git同时管理GitHub与Gitee 12345678910111213141516171819202122232425261. 查看远程仓库地址git remote -v2. 重命名远程仓库git remote rename origin github3. 添加新的远程仓库git remote add gitee https://gitee.com/gozhuyinglong/blog-demos.git4. 多个远程仓库推拉git 2021-12-11 生物信息学 #生物信息学 #git #github #gitee
R语言生成Linux命令 1234567891011121314151617181920212223242526272829303132333435363738394041rm(list = ls())pac4xiang::loadmypackages()df.id <- data.table::fread("id.txt", header = FALSE)comm <- NULLfor (i in df.id 2023-01-10 生物信息学 #生物信息学
MCScanX遇到的一个坑 输入一个巨大的基因组都没有得到结果,最后发现gff文件需要整理成这样的才行: 123456789101_352 Zm00001eb015320_T001 52489256 524909011_352 Zm00001eb015320_T002 52489256 524909011_352 Zm00001eb015320_T003 524894 2023-04-16 生物信息学 #软件使用
清理WinSXS文件夹 以管理员身份运行cmd命令行,输入下方代码即可: 1Dism /online /Cleanup-Image /StartComponentCleanup 2020-12-25 技能 #技能
相关性分析和回归分析 一直把相关性分析和回归计算搞混,某次组会下定决心把这两个东西分清楚。 Items 相关性 简单回归 量化关系方向 √ √ 量化关系强度 √ √ 展示因果和效应 × √ 是否能够进行预测 × √ 变量之间的位置是否能够互换 √ × 表达方式 一个数值 一个等式 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmai 2021-11-26 统计学 #生物信息学 #统计学 #相关性 #回归分析
记录一次hexo无法推送的解决方法 突然就不能将博客推送上服务器,重启服务器和电脑都没用,还把软件都重新装了一遍,还是不行。 最后是把git ssh的公钥重新生成,把服务器上的authorized_keys替换成新的公钥才解决这个问题。 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-01-07 软件使用 #生物信息学 #软件使用 #hexo