根据进化树的距离挖掘新的抗性基因：OsWRKY71, a rice transcription factor, is involved in rice defense response - ScienceDirect PLS-DA用于微生物组数据分析：Frontiers | Comparison of the Ocular Microbiomes of Dry Eye Patients With

去年写了个小总结，包含了文献检索等（简书地址：https://www.jianshu.com/p/3e17e9b7fac8）。

种质资源是极其重要的资源，随着世界人口的增加，对粮食产量的要求越来越高，包括产量和质量。但是，

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文献信息 Tsuda K, Somssich I E. Transcriptional networks in plant immunity[J]. New Phytologist, 2015, 206(3): 932-947. Summary除了大量的非生物胁迫外，植物还时刻都需要面对大量来自其周围环境中的病原菌。因此，在进化过程中的生存和繁殖能力在很大程度上依赖于对这些潜在威胁的有效感知、响

通用数据库http://bigd.big.ac.cn/databasecommons/ 国家基因库下属数据库，涵盖各种生物的全面公开可用的数据信息

混乱的术语诱导抗性（Induced Resistance，IR）是指曾经受到病原菌、昆虫、有益微生物、化学物质、物理损伤或取食等刺激的植物当再次受到这些刺激时比那些没有受过刺激的植物有着更低的敏感性。除了直接可以观察到的对病原菌或昆虫敏感性降低以外，还可以从防御响应水平上对IR进行评估，如活性氧增加、更多的胼胝质沉积、表观遗传变化、转录变化、蛋白质组变化及代谢变化等。这些效应和病原菌相关分子模式、

文献信息 Ampt E A, van Ruijven J, Zwart M P, et al. Plant neighbours can make or break the disease transmission chain of a fungal root pathogen[J]. New Phytologist, 2022, 233(3): 1303-1316. 数据信息 代码和数据链接

文献信息 Pélissier R, Ducasse A, Ballini E, et al. A major genetic locus in neighbours controls changes of gene expression and susceptibility in intra‐specific rice mixtures[J]. New Phytologist, 2023. Su

看到这样一篇文献$^{[1]}$，利用转录组研究水稻-稻瘟病互作过程中的核心基因。想着水稻-稻瘟病互作中转录组研究还有啥好做的呢，结果仔细一看，直呼精彩，尤其是转录组数据分析思路何技巧，让我受益匪浅。 试验设计首先是试验设计很巧妙，利用一个感病品种Nipponbare和抗性品种Hui1586为材料，在温室进行稻瘟病接种，然后12h、24h、36h及48h进行采样。每个时间点都设置了对照。对叶片进

以管理员身份运行cmd命令行，输入下方代码即可: 1Dism /online /Cleanup-Image /StartComponentCleanup

摘要许多生物能够有效地区别“近亲”和“陌生人”（这种现象叫亲缘识别，Kin Recognition），并且对“近亲”能够表现出更多的“合作”（positive kin recognition）。但是这种现象在植物中近几年才被关注到。