Nginx端口转发实现80端口访问shiny-server
在{% label /etc/nginx/sites-enabled/ purple %}下的{% label default purple %}文件种添加如下内容： 1234567891011server { server_name www.test.com # 你的shiny的域名 listen 80; location / { proxy_pass htt
shiny4qPCR-qPCR数据处理一站式解决方案
为什么做shiny4qPCRqPCR是现代分子生物学基础，其基本过程涉及引物设计、RNA（DNA）提取、qPCR实验、qPCR数据处理等。从研究生阶段到现在的博士阶段，我需要做大量的qPCR实验，每次数据处理都比较麻烦，虽然已经基本实现流程化了，但还是比较麻烦，因此，以RStudio的shiny-server为基础，写了个shiny app，专门用于处理qPCR相关数据。 注：目前软件源代码尚未
关于VCF和gVCF
gVCF联合分型 vs VCF文件合并：深度解析变异检测的两种策略 在基因组学研究中，多样本变异检测是一个关键步骤。本文深入分析gVCF联合分型和直接VCF合并两种方法的差异、优势和适用场景，帮助研究者选择最适合的分析策略。 📖 目录 概述 技术原理 详细对比 实际应用场景 代码示例 性能评估 最佳实践建议 总结 🎯 概述在多样本基因组变异检测中，研究者通常面临两种主要的数据整合策略
从二代测序数据中鉴定是否含有特定基因
基因组下载下载参考基因组数据。 1234get https://www.mbkbase.org/R498/R498_Chr.soft.fasta.gzget https://www.mbkbase.org/R498/R498_IGDBv3_coreset.tar.gzget https://www.mbkbase.org/R498/R498_CoreSet.pro.tar.gzget https:
从bam文件中提取比对上与否的序列
123samtools view -f 4 file.bam > unmapped.samsamtools view -b -f 4 file.bam > unmapped.bamsamtools view -b -F 4 file.bam > mapped.bam 1samtools view x.bam | awk '$3=="*" {print ">"$1"\n"$1