ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/genbank/ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/refseq/ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/ 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

突然有个用ggplot2画箭头的需求，So，搞它！

NMDS（nonmetric multidimensional scaling，非度量多维尺度分析）是排序（ordination）分析一种。排序分析的目的在于寻找数据的连续性（也就是通过连续的排序轴来展示数据的主要趋势）。

如果在运行hexo init和npm install报错的话，用 Node.js 自带的 Node.js command prompt 执行这两个命令就行了。 在cmd命令行中且切换目录：cd /d d:

123456callDAMs(metabolites.table = metabolites.table, phenotype.table = phenotype.table, group.table = group.table, use.lm = TRUE, use.cor = TRUE, lm.R2 = 0.5)

编者注：2018年New Phytologist 上发表了一篇文章Kin recognition in rice (Oryza sativa) lines$^{[1]}$，在水稻根系分泌物中有一种关键的化合物：尿囊素（allantoin, AT）——可以作为水稻品种间亲缘识别的关键物质。 这篇文章主要讲的是AT在作物非生物胁迫上的效应。

1234567891011121314151617181920212223242526272829303132333435363738394041424344import requestsfrom bs4 import BeautifulSoupfile_path = "D:/OneDrive/NAS/科研相关/PhData/data/生信挖掘/水稻多效基因/data/NCBI.BioProjec

学Python爬虫一周多，今天练练手，爬取了一个自己感兴趣的知乎话题即将步入研究生，有什么忠告？。一共是272个答案，本次爬取的目的是爬取到所有回答者的昵称、个性签名、赞同数以及具体的内容。

12345678ggdraw(p1 + theme_half_open(12)) + draw_plot(inset, .45, .45, .5, .5) + draw_plot_label( c("A", "B"), c(0, 0.45), c(1, 0.95), size = 12 ) 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang11

conda安装 1conda install -c bioconda perl-bioperl 查看bioperl的位置 1find ~/miniconda3/* -name "Seq.pm" 加入环境变量 1export PERL5LIB=/home/lixiang/miniconda3/pkgs/perl-bioperl-1.6.924-4/lib/perl5/site_perl/

从这里开始写正文 Windows + R 键，输入 %UserProfile% 并运行进入用户文件夹； 新建一个 {% label .wslconfig purple %} 文件，写入下面的内容： 1234[wsl2]memory=30Gswap=12Gprocessors=12 先关闭WSL： 1wsl --shutdown 再开启即可： 1wsl 💌lixiang117423

文献信息 Tsuda K, Somssich I E. Transcriptional networks in plant immunity[J]. New Phytologist, 2015, 206(3): 932-947. Summary除了大量的非生物胁迫外，植物还时刻都需要面对大量来自其周围环境中的病原菌。因此，在进化过程中的生存和繁殖能力在很大程度上依赖于对这些潜在威胁的有效感知、响