12345678910111213141516171819202122232425import osfiles = os.listdir("G:\\33Pan_download\\下载数据\\unzip\\")all_genome = open("G:\\33Pan_download\\下载数据\\all_genome.fa","w")for i in files: print(i)

功能概述自动识别样品信息，批量运行Parabricks. Python脚本可以命名为05.run_parabricks.py 12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273

我安装的是zsh，安装Mambaforge的时候始终无法使用，运行mamba init显示下面的内容： 123456789101112131415161718no change /home/lixiang/mambaforge/condabin/condano change /home/lixiang/mambaforge/bin/condano change /home/

在最后一步bismark_methylation_extractor的时候，输出的.bedGraph 和 .bismark.cov是空文件，在目标目录下有一大堆的.temp文件。看了mapping这一步的结果的report和summary，是没有问题的。那肯定是哪里有问题了。 各种检索，终于是发现了问题所在，参考no bedGraph output #180: Your genome of in

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/genbank/ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/refseq/ ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/ 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

突然有个用ggplot2画箭头的需求，So，搞它！

NMDS（nonmetric multidimensional scaling，非度量多维尺度分析）是排序（ordination）分析一种。排序分析的目的在于寻找数据的连续性（也就是通过连续的排序轴来展示数据的主要趋势）。

如果在运行hexo init和npm install报错的话，用 Node.js 自带的 Node.js command prompt 执行这两个命令就行了。 在cmd命令行中且切换目录：cd /d d:

123456callDAMs(metabolites.table = metabolites.table, phenotype.table = phenotype.table, group.table = group.table, use.lm = TRUE, use.cor = TRUE, lm.R2 = 0.5)

编者注：2018年New Phytologist 上发表了一篇文章Kin recognition in rice (Oryza sativa) lines$^{[1]}$，在水稻根系分泌物中有一种关键的化合物：尿囊素（allantoin, AT）——可以作为水稻品种间亲缘识别的关键物质。 这篇文章主要讲的是AT在作物非生物胁迫上的效应。

1234567891011121314151617181920212223242526272829303132333435363738394041424344import requestsfrom bs4 import BeautifulSoupfile_path = "D:/OneDrive/NAS/科研相关/PhData/data/生信挖掘/水稻多效基因/data/NCBI.BioProjec

学Python爬虫一周多，今天练练手，爬取了一个自己感兴趣的知乎话题即将步入研究生，有什么忠告？。一共是272个答案，本次爬取的目的是爬取到所有回答者的昵称、个性签名、赞同数以及具体的内容。