小蓝哥的知识荒原
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分子生物常用网站

引物设计网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/
2021-04-05
数据库
#数据库

Hexo博客搭建中遇到的问题及解决方法

公式渲染问题 12npm uninstall hexo-renderer-marked --savenpm install hexo-renderer-kramed --save 找到node_modules\kramed\lib\rules\inline.js这个文件,修改对应位置: 12345// escape: /^\\([\\`*{}\[\]()#$+\-.!_>])/, e
2021-12-20
软件使用
#博客搭建 #软件使用

R语言传参示例

1234567891011121314rm(list = ls())args <- commandArgs()df = data.table::fread(args[1], encoding = "UTF-8") %>% dplyr::mutate(n = stringr::str_length(sequence))df = df %>% tibble::add_row(
2022-04-23
生物信息学
#生物信息学 #R

混合效应模型学习笔记

线性回归模型的局限性正态性判断不依赖于直方图,而是构建一个模型,看模型的残差。
2024-02-27
生物信息学
#生物信息学

代谢组S-plot

经过一翻探索,终于把OPLS-DA里面的S-plot给搞清楚了!
2020-12-16
R语言
#R语言

多组学解析荞麦抗立枯丝核菌的分子机制

文献信息 Multi-omics analysis reveals the molecular mechanisms underlying virulence in Rhizoctonia and jasmonic acid–mediated resistance in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum) 研究背景 立枯丝核菌(Rhizoctonia
2023-05-01
文献阅读
#文献阅读

植物科学常用数据库和生物信息学工具

通用数据库http://bigd.big.ac.cn/databasecommons/ 国家基因库下属数据库,涵盖各种生物的全面公开可用的数据信息
2020-12-17
数据库
#数据库

密码子表

💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
2021-12-08
分子生物学
#生物信息学 #分子生物学 #遗传学

根际微生物调控水稻分蘖

1 材料方法 实验设计与样本采集 田间试验设计:使用182个基因组测序水稻品种(来自美国农业部水稻种质资源库的Mini-core集合),在两个田间(I和II)随机种植并重复。 微生物与表型数据收集:采集根际微生物样本(基于16S rRNA测序),统计分蘖数,每个品种3-6个生物学重复,共获得2,128个根样本和78,653,817条高质量测序序列。 数据分析:通过线性回归模型评估根际微生物
2025-04-24
文献阅读
#文献阅读

eggNOG-mapper本地化

从GitHub克隆项目 1git clone https://github.com/eggnogdb/eggnog-mapper.git 下载数据库放在data文件夹下并解压 开始使用 需要安装diamond,版本越新越好 python:需要使用python3 i:输入文件 out:输出文件 m:使用diamond比对 1python emapper.py -i pep.fa --ou
2022-08-11
生物信息学
#生物信息学

组合遗传变异增强植物生产力

文献信息 Wuest S E, Pires N D, Luo S, et al. Increasing plant group productivity through latent genetic variation for cooperation[J]. Plos Biology, 2022, 20(11): e3001842. 摘要信息 Historic yield advances in
2023-05-09
文献阅读
#文献阅读

Rstudio-Server安装igraph报错解决

加载igraph时报错: 123错误: package or namespace load failed for ‘phyloseq’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...): 无法载入共享目标对象‘/usr/local/lib/R/site-library/igraph/libs/igraph.so’:: libglpk.so.40: 无法打开共享对
2024-03-07
生物信息学
#生物信息学
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