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参考文献 Gesesse C A, Nigir B, de Sousa K, et al. Genomics-driven breeding for local adaptation of durum wheat is enhanced by farmers’ traditional knowledge[J]. Proceedings of the National Academy of Scie

下载安装Rshiny-server参考链接： https://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1610162005&ver=2817&signature=BhA59HXhKAj1PYvJS11senjcK8co0LgnZ2iS-7RlClhHqqsESkCMVrw*HFaCnmTHdlC9CiGzbKV*xlzUOr6hXj6vME

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🧬 k-mer：生物信息学中的”文字片段”🔤 什么是k-mer？k-mer 就是从DNA序列中截取的固定长度的片段，就像从一篇文章中截取固定字数的词组一样。 📝 通俗类比想象你有一句话：”我爱吃苹果” 如果k=2，那么2-mer就是：我爱、爱吃、吃苹、苹果 如果k=3，那么3-mer就是：我爱吃、爱吃苹、吃苹果 对于DNA序列也是一样的道理！ 🧪 DNA序列的k-mer示例原始DNA

1234567891011121314151617181920212223242526272829303132333435363738394041424344454647484950515253545556575859606162636465server { listen 80; server_name blog.blog4xiang.world shiny.blog4x

看到这样一篇文献$^{[1]}$，利用转录组研究水稻-稻瘟病互作过程中的核心基因。想着水稻-稻瘟病互作中转录组研究还有啥好做的呢，结果仔细一看，直呼精彩，尤其是转录组数据分析思路何技巧，让我受益匪浅。 试验设计首先是试验设计很巧妙，利用一个感病品种Nipponbare和抗性品种Hui1586为材料，在温室进行稻瘟病接种，然后12h、24h、36h及48h进行采样。每个时间点都设置了对照。对叶片进

12345678910111213141516171819202122232425262728rm(list = ls())# 安装并加载必要的包library(piecewiseSEM)library(lavaan)# 读取数据dat <- read.csv("~/Downloads/MYDATA(1).csv", header = T, row.names = 1)all.scaled

取消前是这样的（强迫症患者表示受不了啊。。。。。。）： 取消方法： 在设置文件settings.json文件中加入下面的内容即可： 12345"workbench.colorCustomizations": { "editorError.foreground": "#00000000", "editorWarning.foreground": "#00000000

第一章：导论 定量变量可以叫做协变量，定性变量叫做因子。 因子需要进行数字化编码才能用在统计模型中，转换后叫做伪变量。 因子有n个水平时，伪变量至少需要n-1个。 合适的模型的标准：简单和准确。 第二章：线性回归模型简介与回顾 线性回归模型是广义线性模型的一种特殊形式。 线性回归模型的定义 \begin{cases} var[y_i] = \frac{\sigma^2}{w_i}\\ \mu_

GEMMA 自动化 GWAS 分析流程目录 简介 核心功能 环境要求 安装与准备 软件安装 输入文件准备 使用方法 快速开始 参数详解 工作流程详解 输出文件说明 重要注意事项 简介本项目是一个自动化的GWAS（全基因组关联分析）流程脚本，它将从原始的VCF文件和表型数据开始，一直到生成最终的显著性位点列表，极大地简化了使用PLINK和GEMMA进行分析的复杂步骤。 该脚本特别设计用于处