featurecounts使用 下载 1wget https://jaist.dl.sourceforge.net/project/subread/subread-2.0.2/subread-2.0.2-Linux-x86_64.tar.gz 将bin目录加入到环境变量即可。 使用案列 1234567/srv/software/subread/bin/featureCounts -p -t exon -g transcr 2022-01-01 生物信息学 #生物信息学 #featurecounts
frp内网穿透 项目地址:https://github.com/fatedier/frp/ 服务端配置 123456789101112131415161718[common]# frp监听的端口,默认是7000,可以改成其他的bind_addr = 0.0.0.0bind_port = 70000# 授权码,请改成更复杂的token = pl00000000000# frp管理后台端口,请按自己需求更改das 2022-01-02 生物信息学 #生物信息学 #软件使用
ggmotif的使用 激发我开发这个R包的原因是在许做基因家族分析中的motif分析的时候总是找不到趁手的工具去可视化相关的结果,要么是在线网站,要么是别人开发的工具,网页版工具怕哪天就跑路了,别人的工具想要个性化比较困难。那,就自己写一个吧。 R包下载安装: 1234install.packages("ggmotif")# 或者devtools::install_github("lixiang117423/ggmot 2021-11-25
gff文件缺少gene特征 1awk -F"[\t=]" 'BEGIN{OFS="\t"}{if($3=="mRNA"){print $1,$2,"gene",$4,$5,$6,$7,$8,$9"="$10 ; print $1,$2,$3,$4,$5,$6,$7,$8,$9"="$10"Parent="$10;}else{print $0}}' all.gff3 > all.gff3.new 复制粘贴使用: 1aw 2022-10-02 生物信息学 #生物信息学
ggplot2分面填充色与字体大小 12theme(strip.text = element_text(face = "bold",size = rel(1.2)), strip.background = element_rect(fill = "white",colour = "black",size = 1)) 2020-12-21 R语言 #R语言
ggsave保存tiff文件报错 12Warning message:In grDevices::dev.off() : agg could not write to the given file 是ggplot2版本的问题,3.3.4正常,3.3.5就会报错。安装旧版本解决问题。 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-04-04 生物信息学 #生物信息学 #R
git同时管理GitHub与Gitee 12345678910111213141516171819202122232425261. 查看远程仓库地址git remote -v2. 重命名远程仓库git remote rename origin github3. 添加新的远程仓库git remote add gitee https://gitee.com/gozhuyinglong/blog-demos.git4. 多个远程仓库推拉git 2021-12-11 生物信息学 #生物信息学 #git #github #gitee