安装123mamba create -n magpurify2 mamba activate magpurify2 pip install magpurify2 数据库下载数据库存放在谷歌云盘上，有15G，我选择临时租个阿里云新加坡的服务器下载了再传回来。 12345fileId="1ooWiR3LplBy5GsY5wZ7o6dwswiCWVvmi"fileName="

相当惊艳的一个包，简单学习了下。

柳枝稷简介柳枝稷是多年生草本植物，主要有南北两个生态型。 重要的生物燃料：较高的能量效率+较好耐旱性； 合适的牛饲料； 水土保持功能； 鸟类保育功能。 研究目的柳枝稷是单子叶植物，同为单子叶植物的玉米和水稻在响应干旱胁迫时都有着特异性的代谢反应，但是还没有柳枝稷响应干旱胁迫时特异性代谢的相关研究。 研究方法 研究结果在干旱胁迫3~4周的时候两个柳枝稷展示出明显的耐旱差异（上图，左侧为处理，右

FASTA和FASTQ文件格式FASTAFASTA是已知序列的存储文件，以>开头，

R语言处理植物病害数据 R语言处理空间地图数据

参考文献 Gesesse C A, Nigir B, de Sousa K, et al. Genomics-driven breeding for local adaptation of durum wheat is enhanced by farmers’ traditional knowledge[J]. Proceedings of the National Academy of Scie

下载安装Rshiny-server参考链接： https://mp.weixin.qq.com/s?src=11&timestamp=1610162005&ver=2817&signature=BhA59HXhKAj1PYvJS11senjcK8co0LgnZ2iS-7RlClhHqqsESkCMVrw*HFaCnmTHdlC9CiGzbKV*xlzUOr6hXj6vME

12345678910111213141516171819202122232425262728import requestsfrom bs4 import BeautifulSoupfile_out = open("D:/群晖NAS/Desktop/MEME网站结果/JASPAR.爬虫结果.txt", "w")with open("D:/群晖NAS/Desktop/MEME网站结果/JASPAR.

123456789101112131415161718192021222324252627282930import osimport reimport argparseimport subprocessparser = argparse.ArgumentParser(description="You should add those parameters")parser.add_argument(

🧬 k-mer：生物信息学中的”文字片段”🔤 什么是k-mer？k-mer 就是从DNA序列中截取的固定长度的片段，就像从一篇文章中截取固定字数的词组一样。 📝 通俗类比想象你有一句话：”我爱吃苹果” 如果k=2，那么2-mer就是：我爱、爱吃、吃苹、苹果 如果k=3，那么3-mer就是：我爱吃、爱吃苹、吃苹果 对于DNA序列也是一样的道理！ 🧪 DNA序列的k-mer示例原始DNA

1234567891011121314151617181920212223242526272829303132333435363738394041424344454647484950515253545556575859606162636465server { listen 80; server_name blog.blog4xiang.world shiny.blog4x

看到这样一篇文献$^{[1]}$，利用转录组研究水稻-稻瘟病互作过程中的核心基因。想着水稻-稻瘟病互作中转录组研究还有啥好做的呢，结果仔细一看，直呼精彩，尤其是转录组数据分析思路何技巧，让我受益匪浅。 试验设计首先是试验设计很巧妙，利用一个感病品种Nipponbare和抗性品种Hui1586为材料，在温室进行稻瘟病接种，然后12h、24h、36h及48h进行采样。每个时间点都设置了对照。对叶片进