小蓝哥的知识荒原
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2023-05-13
生物信息学
#生物信息学

iTAK简明教程

iTAK是植物转录因子、转录调节子及转录激酶预测的工具,使用简单。
2021-06-01
生物信息学
#生物信息学

iTOL修饰进化树

绘制进化树的软件很多,窗口界面的MEGA$^{[1]}$、Y叔R包ggtree$^{[2]}$等。MEGA属于神仙级别的软件,一篇文章拉高期刊的影响因子。而Y的ggtree更受R爱好者的青睐,可以各种尽情修饰进化树。相对来说,MEGA建的树就不是那么好看,需要后期修饰一下。修饰的软件推荐iTOL$^{[3]}$。大多数的参数直接在右边界面就能修改,但是如果需要批量修改颜色等信息的话,就需要写配置文
2020-01-09
生物信息学
#生物信息学

iTOL辅助R包itol.toolkit学习笔记

写在前面还是学学这个点点鼠标就能搞定的神器iTOL。。。PS:其实暑假是闲着没事干了,数据在服务器跑着要一个月。 安装直接从GitHub安装最新版: 1devtools::install_github("TongZhou2017/itol.toolkit") 快速开始123456789101112131415161718192021222324library(itol.toolkit)# read
2023-07-17
生物信息学
#生物信息学

mlr3随机森林

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2022-03-23
生物信息学
#生物信息学 #R语言 #机器学习

{"$schema":"http://json-schema.org/draft-07/schema#","title":"FullConfig","type":"object","properties":{"$schema":{"default":"https://starship.rs/config-schema.json","type":"string"},"aws":{"default":
2025-03-22

Kraken taxonomic sequence classification system Version 2.1.3 Operating Manual Table of Contents Introduction System Requirements Installation Kraken 2 Databases Standard Kraken 2 Databa
2025-03-22
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