html学习笔记 12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697989910010110210 2023-05-13 生物信息学 #生物信息学
iTOL修饰进化树 绘制进化树的软件很多,窗口界面的MEGA$^{[1]}$、Y叔R包ggtree$^{[2]}$等。MEGA属于神仙级别的软件,一篇文章拉高期刊的影响因子。而Y的ggtree更受R爱好者的青睐,可以各种尽情修饰进化树。相对来说,MEGA建的树就不是那么好看,需要后期修饰一下。修饰的软件推荐iTOL$^{[3]}$。大多数的参数直接在右边界面就能修改,但是如果需要批量修改颜色等信息的话,就需要写配置文 2020-01-09 生物信息学 #生物信息学
iTOL辅助R包itol.toolkit学习笔记 写在前面还是学学这个点点鼠标就能搞定的神器iTOL。。。PS:其实暑假是闲着没事干了,数据在服务器跑着要一个月。 安装直接从GitHub安装最新版: 1devtools::install_github("TongZhou2017/itol.toolkit") 快速开始123456789101112131415161718192021222324library(itol.toolkit)# read 2023-07-17 生物信息学 #生物信息学
mlr3随机森林 12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697989910010110210 2022-03-23 生物信息学 #生物信息学 #R语言 #机器学习
{"$schema":"http://json-schema.org/draft-07/schema#","title":"FullConfig","type":"object","properties":{"$schema":{"default":"https://starship.rs/config-schema.json","type":"string"},"aws":{"default": 2025-03-22
Kraken taxonomic sequence classification system Version 2.1.3 Operating Manual Table of Contents Introduction System Requirements Installation Kraken 2 Databases Standard Kraken 2 Databa 2025-03-22