AlphaGenome 使用指南AlphaGenome 是一个强大的 DNA 序列预测模型，可以从 DNA 序列中预测多种基因组功能输出。本指南总结了其主要功能和使用方法。 安装和导入12345678910111213# 安装! pip install alphagenome# 主要导入from alphagenome.data import gene_annotationfrom alphage

安装Nginx： 1sudo apt-get install nginx 找个位置存放{% label bookdown purple %}编译好的文件夹，里面包含了整个的静态文件，如我的是{% label book4xiang purple %}。 修改配置文件： 12345678910111213cd /etc/nginx/conf.d/# 创建一个bookdown.conf,输入

安装PostgreSQL1234567891011121314151617181920212223242526sudo apt update && sudo apt upgradesudo apt-cache search postgresql | grep postgresqlsudo sh -c 'echo "deb http://apt.postgresql.org/pub/

项目地址：https://github.com/fatedier/frp/ 服务端配置 123456789101112131415161718[common]# frp监听的端口，默认是7000，可以改成其他的bind_addr = 0.0.0.0bind_port = 70000# 授权码，请改成更复杂的token = pl00000000000# frp管理后台端口，请按自己需求更改das

在R语言中绘制韦恩图通常有两种方法，小于5个集合的用R包VennDiagram即可完成绘制；超过5个的使用R包UpSetR进行绘制。 VennDiagram12345678910111213141516171819202122232425262728rm(list = ls())data.test = data.frame(A = rep(c('a','b','c'),c(10,23,17)),

参考流程：https://nf-co.re/dualrnaseq/1.0.0/usage Ewels P A, Peltzer A, Fillinger S, et al. The nf-core framework for community-curated bioinformatics pipelines[J]. Nature biotechnology, 2020, 38(3): 276-

12345678910111213---title: "YYT data analysis report"author: "Xiang Li"date: '2022-06-06'output: html_document: toc: true toc_depth: 3 toc_float: true #theme: united css: style.css

文献信息 Wilkinson S W, Hannan Parker A, Muench A, et al. Long-lasting memory of jasmonic acid-dependent immunity requires DNA demethylation and ARGONAUTE1[J]. Nature Plants, 2023: 1-15. 研究背景 水杨酸（SA）参与的防

点击下载文献PDF版本 摘要尿囊素是植物氮素移动相关的嘌呤分解代谢通路中的中间产物，其广泛地存在于植物中，是植物中重要的氮素形态。近些年的研究表明尿囊素能够有效增强植物对干旱胁迫、盐胁迫、冷害胁迫、重金属胁迫及辐射胁迫等非生物胁迫的耐受性。尿囊素含量的积累会诱导ABA生物合成相关基因的表达，从而激活下游胁迫相关基因的表达。当尿囊素作为信号物质进行外源施用时，会导致ABA和JA通路的串扰，从而增强植

一开始折腾的是GAPIT，可是老是报错，实在是没办法了，就折腾TASSEL. 参考文献 Bradbury P J, Zhang Z, Kroon D E, et al. TASSEL: software for association mapping of complex traits in diverse samples[J]. Bioinformatics, 2007, 23(19): 263

常用的基础统计函数每次都要对统计分析的结果进行提取，稍微有些麻烦，索性写个函数，后期封装成R包，方便自己直接调用。