在R语言中绘制韦恩图通常有两种方法，小于5个集合的用R包VennDiagram即可完成绘制；超过5个的使用R包UpSetR进行绘制。 VennDiagram12345678910111213141516171819202122232425262728rm(list = ls())data.test = data.frame(A = rep(c('a','b','c'),c(10,23,17)),

参考流程：https://nf-co.re/dualrnaseq/1.0.0/usage Ewels P A, Peltzer A, Fillinger S, et al. The nf-core framework for community-curated bioinformatics pipelines[J]. Nature biotechnology, 2020, 38(3): 276-

12345678910111213---title: "YYT data analysis report"author: "Xiang Li"date: '2022-06-06'output: html_document: toc: true toc_depth: 3 toc_float: true #theme: united css: style.css

文献信息 Wilkinson S W, Hannan Parker A, Muench A, et al. Long-lasting memory of jasmonic acid-dependent immunity requires DNA demethylation and ARGONAUTE1[J]. Nature Plants, 2023: 1-15. 研究背景 水杨酸（SA）参与的防

点击下载文献PDF版本 摘要尿囊素是植物氮素移动相关的嘌呤分解代谢通路中的中间产物，其广泛地存在于植物中，是植物中重要的氮素形态。近些年的研究表明尿囊素能够有效增强植物对干旱胁迫、盐胁迫、冷害胁迫、重金属胁迫及辐射胁迫等非生物胁迫的耐受性。尿囊素含量的积累会诱导ABA生物合成相关基因的表达，从而激活下游胁迫相关基因的表达。当尿囊素作为信号物质进行外源施用时，会导致ABA和JA通路的串扰，从而增强植

一开始折腾的是GAPIT，可是老是报错，实在是没办法了，就折腾TASSEL. 参考文献 Bradbury P J, Zhang Z, Kroon D E, et al. TASSEL: software for association mapping of complex traits in diverse samples[J]. Bioinformatics, 2007, 23(19): 263

常用的基础统计函数每次都要对统计分析的结果进行提取，稍微有些麻烦，索性写个函数，后期封装成R包，方便自己直接调用。

突然无法登录Rstudio Server，后台报错： 1ERROR The previous R session terminated abnormally; LOGGED FROM: rstudio::core: 实在是找不到报错的原因，kill掉Rsession也不行，重启服务器也不行。 解决方案如下： 删除用户目录下的这个文件夹即可.local/share/**rstudio**。

12Warning message:In grDevices::dev.off() : agg could not write to the given file 是ggplot2版本的问题，3.3.4正常，3.3.5就会报错。安装旧版本解决问题。 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

安装官方版本 1234567891011wget https://raw.githubusercontent.com/ohmyzsh/ohmyzsh/master/tools/install.sh sh install.shsudo apt install powerline fonts-powerline #安装字体sudo apt install zsh-syntax-highlighti

Rstudio-Server绘图报错： 1234Error in RStudioGD() : Shadow graphics device error: r error 4 (Error : C stack usage 7969364 is too close to the limit)此外: There were 50 or more warnings (use warnings() to