参考文献 Lin X, Jia Y, Heal R, et al. Solanum americanum genome-assisted discovery of immune receptors that detect potato late blight pathogen effectors[J]. Nature Genetics, 2023: 1-10. 研究背景马铃薯晚疫病是由Phyto

安装安装使用mamba即可。 下载下载地址：https://data.gtdb.ecogenomic.org/releases/release214/214.1/auxillary_files/ 下载最大的这个文件： 下载完成后解压即可。 配置初次运行显示： 将数据库软连接过去即可： 1ln -s ~/database/gtdb.v207/* ~/mambaforge/envs/metagen

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《Nature》论文NLR基因分析方法深度解析核心目标本研究的核心生物信息学目标是，在52个马铃薯基因组（代表Solanum section Petota）中，进行全面且高度精确的NLR基因重新注释，构建一个综合性的“NLRome”，并基于此进行深入的比较基因组学和进化分析，最终指导功能基因的克隆和抗性工程。 分析模块一：NLR基因的重新注释 (Reannotation of Nucleotid

12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697989910010110210

123ls data/sra/ | while read id; do parallel-fastq-dump -s ./data/sra/$id --o ./data/fastq --split-files -t 30; donenohup ls data/sra | while read id; do hisat2 -p 30 -x index/genome.index -1 data/fas

12345678910111213141516# 创建环境conda create -n bioperlconda activate bioperlconda install -c bioconda perl-bioperl# 查找Bioperl位置find anaconda3/* -name "Seq.pm"# 输出/home/lixiang/miniconda3/envs/bioperl/li

红豆单一驯化起源研究：重大发现与科学突破这项发表在《Science》上的研究通过多学科整合方法，解决了红豆驯化起源的长期争议，揭示了作物驯化的复杂演化过程。 研究背景：考古学与遗传学的矛盾争议焦点： 考古证据：日本最早栽培记录（4-6千年前） 遗传证据：中国中部栽培品种遗传多样性最高 核心问题：到底是日本驯化还是中国驯化？ 重大发现一：确认日本单一驯化起源核心证据叶绿体基因组分析（技术：821

AlphaGenome 使用指南AlphaGenome 是一个强大的 DNA 序列预测模型，可以从 DNA 序列中预测多种基因组功能输出。本指南总结了其主要功能和使用方法。 安装和导入12345678910111213# 安装! pip install alphagenome# 主要导入from alphagenome.data import gene_annotationfrom alphage

安装Nginx： 1sudo apt-get install nginx 找个位置存放{% label bookdown purple %}编译好的文件夹，里面包含了整个的静态文件，如我的是{% label book4xiang purple %}。 修改配置文件： 12345678910111213cd /etc/nginx/conf.d/# 创建一个bookdown.conf,输入

安装PostgreSQL1234567891011121314151617181920212223242526sudo apt update && sudo apt upgradesudo apt-cache search postgresql | grep postgresqlsudo sh -c 'echo "deb http://apt.postgresql.org/pub/

项目地址：https://github.com/fatedier/frp/ 服务端配置 123456789101112131415161718[common]# frp监听的端口，默认是7000，可以改成其他的bind_addr = 0.0.0.0bind_port = 70000# 授权码，请改成更复杂的token = pl00000000000# frp管理后台端口，请按自己需求更改das