一直想写写自己的生信之路，一直耽误，一直没有完成，今天收完实验室，晚上写写这个，就当放松了。 我的生信水平按照行业的说法，我现在的水平就是Level 0。简单来说就是跑流程。转录组、微生物组、代谢组啥的都能跑跑流程。 初识生信那是我刚刚本科毕业的时候，2018年7月的时候，由于考研考的本校，本科毕业就直接进实验室继续做实验学习。那时候我根本不知道什么是生物信息学，只是听导师偶尔提提。当时手里在做的

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高效的序列比对和相似性搜索工具 | Efficient Sequence Alignment and Similarity Search Tool 📖 功能概述 | OverviewBLAST比对分析模块是一个强大的序列比对工具，支持多种BLAST算法，提供灵活的输入方式和丰富的参数配置，适用于各种生物信息学序列分析需求。 ✨ 主要特性 | Key Features 🔬 多种BLAST算法:

软件配置DeepLoc 2.0参考文献： Thumuluri V, Almagro Armenteros J J, Johansen A R, et al. DeepLoc 2.0: multi-label subcellular localization prediction using protein language models[J]. Nucleic acids research, 2

摘要许多生物能够有效地区别“近亲”和“陌生人”（这种现象叫亲缘识别，Kin Recognition），并且对“近亲”能够表现出更多的“合作”（positive kin recognition）。但是这种现象在植物中近几年才被关注到。

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浅言前言软件安装Linux基础报错及解决方案 Some index files failed to download. They have been ignored, or old ones used instead.：编辑vi /etc/resolv.conf，加入： 12nameserver 8.8.8.8nameserver 8.8.4.4 Nginx 不同域名指定端口 12345678

系统发育树构建中的不同模型指的是在建立系统发育树（phylogenetic tree）时所使用的不同计算模型，这些模型用于描述不同的进化历程。它们通常基于分子序列数据或形态特征数据，并用来估计进化距离、基因替换率、分支长度和概率等参数。 一些常见的系统发育树构建模型包括： JC69 模型：最简单的核苷酸取代模型，假设所有碱基变异的概率相等。 K80 模型：假设两种碱基之间的取代率可能不同。 F8

完整工作流程步骤1：找到所有基因组共有的序列（核心序列）12# 找所有30个基因组都有的唯一匹配序列mumemto mum -o core_sequences -l 100 rice_genome_*.fa 参数说明： 默认：匹配必须在所有序列中出现，且每个序列中只出现一次 -l 100：设置最小匹配长度为100bp 步骤2：找到每个基因组特有的序列12# 找每个基因组独有的序列（只在1个基因

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