Docker部署nextcloud修改配置文件 找到对应的文件修改即可: 1find /var -name "config.php" 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-01-17 生物信息学 #生物信息学
Docker配置阿里云镜像 登录阿里云获取专用镜像链接:https://cr.console.aliyun.com/cn-hangzhou/instances/mirrors 修改配置文件 1sudo vi /etc/docker/daemon.json 加入下面的内容: 123{ "registry-mirrors": ["https://xxxxxxx.mirror.aliyuncs.com"]} 💌l 2022-06-19 生物信息学 #生物信息学
DualRNA-Seq分析流程 参考流程:https://nf-co.re/dualrnaseq/1.0.0/usage Ewels P A, Peltzer A, Fillinger S, et al. The nf-core framework for community-curated bioinformatics pipelines[J]. Nature biotechnology, 2020, 38(3): 276- 2021-12-29 生物信息学 #生物信息学
GAPIT3笔记 安装 服务器编译失败,转用腾讯云安装,然后将对应的R包拷贝到服务器上。 示例 12345678910111213library(GAPIT3)myY <- read.table("~/temp_file/GAPIT3-master/inst/extdata/mdp_traits.txt", head = TRUE)myGD=read.table(file="~/temp_file/G 2022-04-21 生物信息学 #生物信息学
Conda安装最新版R 1234conda config --add channels conda-forgeconda config --set channel_priority strictconda search r-baseconda install -c conda-forge r-base=4.1.2 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-03-28 生物信息学 #生物信息学
GTDB-Tk数据库配置 安装安装使用mamba即可。 下载下载地址:https://data.gtdb.ecogenomic.org/releases/release214/214.1/auxillary_files/ 下载最大的这个文件: 下载完成后解压即可。 配置初次运行显示: 将数据库软连接过去即可: 1ln -s ~/database/gtdb.v207/* ~/mambaforge/envs/metagen 2023-07-14 生物信息学 #生物信息学
HRP鉴定NB-LRR基因所有代码 123456789101112131415161718bash /usr/bin/interproscan.sh -f TSV -app Pfam -i data/proteins.fa -b results/1-interproscangrep NB-ARC results/1-interproscan.tsv | cut -f1,7,8 > results/2-interproscan. 2022-04-08 生物信息学 #生物信息学
Hexo博客搭建中遇到的问题及解决方法 公式渲染问题 12npm uninstall hexo-renderer-marked --savenpm install hexo-renderer-kramed --save 找到node_modules\kramed\lib\rules\inline.js这个文件,修改对应位置: 12345// escape: /^\\([\\`*{}\[\]()#$+\-.!_>])/, e 2021-12-20 软件使用 #博客搭建 #软件使用
KEGGREST用法 12library(KEGGREST) kegg <- keggGet("ko01120") 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-01-18 生物信息学 #生物信息学
Julia学习笔记 软件安装等 安装GLmakie报错 1]add StatsFuns@0.9.3 数据导入导出点击下载JupyterLab笔记 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2021-12-29 Julia #生物信息学 #软件使用
LeAFtool计算病斑面积 网页版地址: https://shiny.web4xiang.top/LeAFtool/ 分析流程数据准备将图片存储在三个文件夹内,压缩成.zip后上传就能进行分析: learning:存放用于训练的图片(直接截图即可),包括三个子文件夹: background:背景图片。如叶片是贴在A4纸上的,那么背景就截图A4纸。 limb:没有被病原菌侵染的健康叶片。 lesion:病斑截图。 res 2022-02-26 生物信息学 #生物信息学 #软件使用