记录一次hexo无法推送的解决方法
突然就不能将博客推送上服务器，重启服务器和电脑都没用，还把软件都重新装了一遍，还是不行。 最后是把git ssh的公钥重新生成，把服务器上的authorized_keys替换成新的公钥才解决这个问题。 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
记一次Docker使用的坑
最近在使用谷歌的DeepVariant处理三代数据，然后发现某个文件系统爆满了。。。。。。 1/dev/sda2 439G 439G 0G 0% / 然后我就发现Rstudio Server无法使用了（点击跳转），我以为是Rstudio Server出问题了，没多想。晚上的时候我想创建个conda环境，遇到报错说无法写入磁盘，磁盘空间已满。奇了怪了，我的conda是安装在家
记录转录组遇到的一个坑
跑水稻的转录组，96个样品。 前面的所有流程都没有问题，跑到Counts计数的时候，全部都是0！！！不管是HtSeq还是FeatureCounts，计算出来全部都是0。然后我重新下载了别的参考基因组和注释信息，跑出来完全没有问题。一直不知道是哪里出现了问题。我也忘记是怎么排查的了，发现基因组染色体的名称和gtf文件里面的不一样： 基因组文件的染色体编号： 123456789101112>
调控植物-植物互作的地下部分信号
文献信息 Yoneyama K, Bennett T. Whispers in the dark: Signals regulating underground plant–plant interactions[J]. Current Opinion in Plant Biology, 2023: 102456. 摘要植物能够感知周围是否存在其他植物并做出响应，以此来优化自我的生理响应从而保护自
部署Rshiny到服务器的常见问题
下载安装Rshiny-server参考链接： https://mp.weixin.qq.com/s?src=11×tamp=1610162005&ver=2817&signature=BhA59HXhKAj1PYvJS11senjcK8co0LgnZ2iS-7RlClhHqqsESkCMVrw*HFaCnmTHdlC9CiGzbKV*xlzUOr6hXj6vME
钙离子介导的水稻免疫机制
这是一篇让人读完以后叹为观止的文章，精彩，实在是精彩！ 故事是这样开始的，在TP309（粳稻）育种群体中，发现一个很特殊的变种，这个变种携带了一个叫做rod1的基因，这个基因有什么特别的地方呢？通过田间试验和室内试验发现，携带了rod1基因的植株对水稻纹枯病、水稻稻瘟病和水稻白叶枯病这三种严重影响水稻生产的病害都具有广谱抗性（下图ABC）；而且，其植株体内的SA和JA的含量也比TP309的高很多
间作系统中的抗性诱导
文献信息原文链接 研究背景增加栽培系统中的生物多样性能够有效促进农业的可持续发展。间作是增加农田生物多样性的有效手段。间作系统中的植物-植物互作是影响间作系统整体抗性的关键部分（下图）。在植物-植物间作系统中存在多种信号及其传播途径： 地上部分的挥发物性有机化合物：通过空气传播。 地下部分的根系分泌物：植物-植物间直接作用，或者是通过微生物等实现间接作用。 提出科学问题间作系统中的植株受到
DNA甲基化数据分析流程
参考文献 Wilkinson S W, Hannan Parker A, Muench A, et al. Long-lasting memory of jasmonic acid-dependent immunity requires DNA demethylation and ARGONAUTE1[J]. Nature Plants, 2023: 1-15. 原始数据：点击查看 参考基因组E