堆积柱状图加上连接线能够更好地看出变化情况，参照“宏基因组”的教程改写了代码，封装成了一个函数。

安装12345git clone https://github.com/lixiang117423/biopytools.gitcd biopytoolspip install -e .pip install -e ".[dev]" run_annovar主要功能是实现使用Annovar对VCF文件进行注释。 帮助文档1234567891011121314151617181920212223242

广义遗传力（broad-sense heritability）是一个用于描述性状在总体中遗传成分所占比例的统计量。它是指由所有基因效应和环境因素共同决定的某个性状的遗传变异部分与总变异部分之间的比例。 广义遗传力包括了所有遗传因素的影响，包括加性、显性、上位和互作效应等。它通常用 H^2 表示，其取值范围为 0 到 1 之间。当 H^2=0 时，表明该性状完全由环境因素决定；当 H^2=1 时，表

FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads）和TPM（Transcripts Per Million）都是RNA-seq数据中用于标准化基因表达量的指标，它们有以下区别和联系： 主要区别计算顺序不同： FPKM：先按测序深度标准化，再按基因长度标准化 TPM：先按基因长度标准化，再按测序深度标准化 数学表

12library(KEGGREST) kegg <- keggGet("ko01120") 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

软件地址 1https://github.com/inutano/pfastq-dump 批量处理 1for i in SRR*; do pfastq-dump -t 50 -s $i -O fastq/; done 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

写在前面前两天在某个群里面，两个群友争论起来，给我的感受是我们使用某个方法之前还是需要了解基本的概念和用法，

安装Rcpp报错installation of package ‘Rcpp’ had non-zero exit status： 在R的安装目录下启动这个软件： 输入代码： 1install.packages("Rcpp") 提示 Do you want to install from sources the package which needs compilation? (Yes/no/

安装12345678# 这里需要cd到加压缩frp压缩包的文件位置，解压后会看到文件里有frpc的启动程序sudo cp frpc /usr/local/bin/frpcsudo mkdir /etc/frpcsudo cp frpc.ini /etc/frpc/frpc.ini# 按照上面这个配置我一直无法启动，下面的两行代码让我成功运行sudo mkdir /etc/frpssudo cp f

1dplyr::mutate(geneid = stringr::str_split(id, "-") %>% sapply("[", 3)) 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

混乱的术语诱导抗性（Induced Resistance，IR）是指曾经受到病原菌、昆虫、有益微生物、化学物质、物理损伤或取食等刺激的植物当再次受到这些刺激时比那些没有受过刺激的植物有着更低的敏感性。除了直接可以观察到的对病原菌或昆虫敏感性降低以外，还可以从防御响应水平上对IR进行评估，如活性氧增加、更多的胼胝质沉积、表观遗传变化、转录变化、蛋白质组变化及代谢变化等。这些效应和病原菌相关分子模式、

查询历史命令，找到相关的命令并查看最近的： 1alias hg='_hg(){history | grep $1 | tail};_hg'