12library(KEGGREST) kegg <- keggGet("ko01120") 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

软件地址 1https://github.com/inutano/pfastq-dump 批量处理 1for i in SRR*; do pfastq-dump -t 50 -s $i -O fastq/; done 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

写在前面前两天在某个群里面，两个群友争论起来，给我的感受是我们使用某个方法之前还是需要了解基本的概念和用法，

安装Rcpp报错installation of package ‘Rcpp’ had non-zero exit status： 在R的安装目录下启动这个软件： 输入代码： 1install.packages("Rcpp") 提示 Do you want to install from sources the package which needs compilation? (Yes/no/

安装12345678# 这里需要cd到加压缩frp压缩包的文件位置，解压后会看到文件里有frpc的启动程序sudo cp frpc /usr/local/bin/frpcsudo mkdir /etc/frpcsudo cp frpc.ini /etc/frpc/frpc.ini# 按照上面这个配置我一直无法启动，下面的两行代码让我成功运行sudo mkdir /etc/frpssudo cp f

1dplyr::mutate(geneid = stringr::str_split(id, "-") %>% sapply("[", 3)) 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com

混乱的术语诱导抗性（Induced Resistance，IR）是指曾经受到病原菌、昆虫、有益微生物、化学物质、物理损伤或取食等刺激的植物当再次受到这些刺激时比那些没有受过刺激的植物有着更低的敏感性。除了直接可以观察到的对病原菌或昆虫敏感性降低以外，还可以从防御响应水平上对IR进行评估，如活性氧增加、更多的胼胝质沉积、表观遗传变化、转录变化、蛋白质组变化及代谢变化等。这些效应和病原菌相关分子模式、

查询历史命令，找到相关的命令并查看最近的： 1alias hg='_hg(){history | grep $1 | tail};_hg'

参考文献 Denti L, Khorsand P, Bonizzoni P, et al. SVDSS: structural variation discovery in hard-to-call genomic regions using sample-specific strings from accurate long reads[J]. Nature Methods, 2023, 20(

文献信息 Ampt E A, van Ruijven J, Zwart M P, et al. Plant neighbours can make or break the disease transmission chain of a fungal root pathogen[J]. New Phytologist, 2022, 233(3): 1303-1316. 数据信息 代码和数据链接

基因家族分析是一种常见的生物信息学分析套路，也是生物信息学数据挖掘发表小文章常用的分析方法，和GEO挖掘等类似。基因家族的分析鉴定可以用pfam上的hmm文件进行基因家族的检索鉴定，也可以用blast的方法进行比对鉴定，通常是适用拟南芥对应的基因家族进行比对鉴定。植物转录因子数据库，点击访问。 基因家族分析思路及文章撰写思路基因家族分析是继GEO数据挖掘后，一种新的生物信息学挖掘策略。 如何做基因