小蓝哥的知识荒原
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Docker配置阿里云镜像

登录阿里云获取专用镜像链接:https://cr.console.aliyun.com/cn-hangzhou/instances/mirrors 修改配置文件 1sudo vi /etc/docker/daemon.json 加入下面的内容: 123{ "registry-mirrors": ["https://xxxxxxx.mirror.aliyuncs.com"]} 💌l
2022-06-19
生物信息学
#生物信息学

R语言自动跳过Error实现循环

经常要批量读取网页文件,有时候URL会报错,循环的程序就断开了,很麻烦。学习到一种tryCatch的方法。 12345678910111213141516171819202122for (i in 1:nrow(kegg.id)) { tryCatch({ Sys.sleep(0.5) KEGGREST::keggGet(kegg.id$id[i]) -> temp
2023-03-02
生物信息学
#生物信息学

分类-回归树(CART)在R语言中的实现

CART 模型 ,即 Classification And Regression Trees。它和一般回归分析类似,是用来对变量进行解释和预测的工具,也是数据挖掘中的一种常用算法。如果因变量是连续数据,相对应的分析称为回归树,如果因变量是分类数据,则相应的分析称为分类树。
2020-12-22
R语言
#R语言

Python英文文献爬虫

之前写过用Python爬取中文文献,但是更多时候需要的是英文文献,就写了个英文的爬虫代码。
2020-01-12
Python
#Python

服务器安装JupyterLab

安装conda 123wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.shbash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh 修改文件~/.condarc 123456789auto_activate_base: fals
2021-12-28
软件使用
#软件使用 #Ubuntu #JupyterLab

MetaPhlAn4宏基因组数据分析流程学习笔记

参考文献 Blanco-Míguez, A., Beghini, F., Cumbo, F. et al. Extending and improving metagenomic taxonomic profiling with uncharacterized species using MetaPhlAn 4. Nat Biotechnol (2023). 官方网站MetaPhlAn 4.0
2023-06-12
生物信息学
#生物信息学

R语言学习资料推荐

如何快速学习我个人觉得最好的学习方法是这样的: 夯实基础:先把基础打牢(建议学习路径部分); 项目实战:从项目出发,比如我想做微生物组分析,那就去找一篇经典的文献,学习其中的代码,把每行代码的意思搞懂,弄清楚需要的数据类型和结构,自己做项目分析的时候直接套用即可。 先让代码无报错的跑起来,再完善代码的可读性。切记:我们的目的是完成数据分析和可视化,而不是写很好看的代码!!! 建议学习路径 R、
2023-04-14
生物信息学
#生物信息学

hexo新文章无法更新显示问题的解决办法

千万不要把.deploy_git这个文件夹给隐藏了😂 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
2022-03-18
软件使用
#软件使用

ubuntu配置程序开机自动运行

以内网穿透工具frp为例。 要设置 frpc 在 Ubuntu 系统上开机自动启动,你可以创建一个 systemd 服务文件。以下是详细的步骤: 1. 创建 systemd 服务文件首先,使用文本编辑器创建一个新的服务文件。我们将其命名为 frpc.service。 1sudo nano /etc/systemd/system/frpc.service 2. 添加服务配置在打开的文件中,添加以下内
2025-01-21
生物信息
#生物信息学

Ubuntu更新R

123参考链接:https://blog.csdn.net/weixin_41929524/article/details/108470515 12345678sudo suecho "deb http://www.stats.bris.ac.uk/R/bin/linux/ubuntu xenial-cran40/" >> /etc/apt/sources.listapt-key ad
2021-01-09
R语言
#R语言

Tools4You教程3:线性回归分析

界面线性回归分析的界面和t检验的界面很相似。首先在左侧选择对应的模块回归分析,便科研看到如下界面: 数据上传与参数设置数据格式如下:第一列是x,第二列是y,第三列是group,如果只是一组数据的话,在group列输入一个分组名称即可,多组的话对应输入多个分组名称即可。 数据上传完成后,需要选择绘制散点图形状(点击查看散点形状代码)、大小、颜色及透明度,如果没有选择或输入相关的参数,那后续的绘图
2021-01-19
Tools4You
#Tools4You

我精读过的那些Paper

文献标题 一句话描述 文献解读 Long-lasting memory of jasmonic acid-dependent immunity requires DNA demethylation and ARGONAUTE1 茉莉酸诱导的长期免疫需要甲基化的参与 点击查看 A major genetic locus in neighbours controls changes
2023-01-25
文献阅读
#文献阅读
1…1718192021…27

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