参与式育种在基因挖掘中的应用 参考文献 Gesesse C A, Nigir B, de Sousa K, et al. Genomics-driven breeding for local adaptation of durum wheat is enhanced by farmers’ traditional knowledge[J]. Proceedings of the National Academy of Scie 2023-04-06 文献阅读 #文献阅读
基因家族分析 基因家族分析是一种常见的生物信息学分析套路,也是生物信息学数据挖掘发表小文章常用的分析方法,和GEO挖掘等类似。基因家族的分析鉴定可以用pfam上的hmm文件进行基因家族的检索鉴定,也可以用blast的方法进行比对鉴定,通常是适用拟南芥对应的基因家族进行比对鉴定。植物转录因子数据库,点击访问。 基因家族分析思路及文章撰写思路基因家族分析是继GEO数据挖掘后,一种新的生物信息学挖掘策略。 如何做基因 2021-11-25 生物信息学 #生物信息学 #分子生物学 #基因家族
多组学解析荞麦抗立枯丝核菌的分子机制 文献信息 Multi-omics analysis reveals the molecular mechanisms underlying virulence in Rhizoctonia and jasmonic acid–mediated resistance in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum) 研究背景 立枯丝核菌(Rhizoctonia 2023-05-01 文献阅读 #文献阅读
安装MCScanX 点击下载软件压缩包 解压后进入到目录,运行: 1make 如果报错g++: fatal error: 已终止 signal terminated program cc1plus,那就需要修改虚拟内存大小,参考文章https://blog.web4xiang.top/posts/ubuntumemary/。 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gm 2022-03-19 生物信息学 #生物信息学
安装Rcpp报错解决方法 安装Rcpp报错installation of package ‘Rcpp’ had non-zero exit status: 在R的安装目录下启动这个软件: 输入代码: 1install.packages("Rcpp") 提示 Do you want to install from sources the package which needs compilation? (Yes/no/ 2022-03-16 生物信息学 #生物信息学
安装hexo遇到的bug及解决方法 如果在运行hexo init和npm install报错的话,用 Node.js 自带的 Node.js command prompt 执行这两个命令就行了。 在cmd命令行中且切换目录:cd /d d: 2020-12-17 hexo #hexo
宏基因组学习笔记 分析策略以下三个图来自微信公众号[希研未来]。 基于reads 基于组装 基于Bin 软件安装常用的这些软件用Conda或者是mamba都很好处理,但是metaWRAP这个软件是真的难安装啊。踩坑多次终于安装上了: 1mamba create -y --name metawrap-env --channel ursky metawrap-mg=1.3.2 数据配置Che 2023-06-15 生物信息学 #生物信息学
崩溃的一天-配置Minigraph-Cactus 看到这篇文章: 参考文献: Hickey G, Monlong J, Ebler J, et al. Pangenome graph construction from genome alignments with Minigraph-Cactus[J]. Nature Biotechnology, 2023: 1-11. 官方推荐使用docker安装,可是真的不想在实验室服务器上安装doc 2023-11-02 生物信息学 #生物信息学