放弃柱状图吧
关于数据处理和数据展示的一些Tips。
服务器安装JupyterLab
安装conda 123wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.shbash Miniconda2-latest-Linux-x86_64.sh 修改文件~/.condarc 123456789auto_activate_base: fals
服务器部署为知笔记
先安装Docker。 从Docker Hub下载为知笔记的最新镜像 1docker pull wiznote/wizserver 创建文件存放位置 1mkdir wizdata 启动为知笔记镜像 1docker run --name wiz --restart=always -it -d -v ~/wizdata:/wiz/storage -v /etc/localtime:/et
本地构建UniProt数据库进行blast比对
数据库下载下载地址： https://www.uniprot.org/help/downloads 镜像下载地址： https://ftp.expasy.org/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/ 下载速度可以说是非常慢了。买个阿里云的海外服务器中转一下。
氨基酸转运子调控植物免疫-生长平衡
背景知识先天免疫与诱导免疫植物的先天免疫可以分为PTI和ETI。除了先天免疫之外，当植物从生物胁迫中恢复以后，会获得持续时间较长的抗性，这种叫做诱导抗性（induced resistance，IR）。获得IR的植株在遭受第二次侵染时，能够更快更强地做出响应以保护自己。IR通常有如下几种方式： 由先天免疫激发； 由根际微生物激发：如有益微生物； 由特定化合物激发：如挥发性有机化合物和β 氨基酸。
端口转发+SSL证书部署
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结构变异检测软件SVDSS使用
参考文献 Denti L, Khorsand P, Bonizzoni P, et al. SVDSS: structural variation discovery in hard-to-call genomic regions using sample-specific strings from accurate long reads[J]. Nature Methods, 2023, 20(
绘制圆堆积图
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记一次Docker使用的坑
最近在使用谷歌的DeepVariant处理三代数据，然后发现某个文件系统爆满了。。。。。。 1/dev/sda2 439G 439G 0G 0% / 然后我就发现Rstudio Server无法使用了（点击跳转），我以为是Rstudio Server出问题了，没多想。晚上的时候我想创建个conda环境，遇到报错说无法写入磁盘，磁盘空间已满。奇了怪了，我的conda是安装在家