DNA甲基化数据分析流程
参考文献 Wilkinson S W, Hannan Parker A, Muench A, et al. Long-lasting memory of jasmonic acid-dependent immunity requires DNA demethylation and ARGONAUTE1[J]. Nature Plants, 2023: 1-15. 原始数据：点击查看 参考基因组E
RstudioServer报错解决
突然的报错。。。。。。 123👉👉👉➡️ df -hl /tmp文件系统 容量 已用 可用 已用% 挂载点/dev/sda2 439G 426G 0 100% / 原来是这个系统盘爆满了，系统在上面，也不敢随便删文件。 检索一番，找到解决方法：在自己的家目录下创建.Renviron这个文件，输入下面的内容： 1TMP=/home/username
Nature杂志统计知识合集
偶然发现的一个合集：Statistics for Biologists. 统计学不会告诉我们是对还是错，只会告诉我们犯错的可能性！ Statistics does not tell us whether we are right. It tells us the chances of being wrong. 不确定性的重要性 误差棒(Error bar)点击查看文献原文 误差棒有三种类型
README4biohelpers
Some useful script tools written during data processing. Installation12345git clone git@github.com:lixiang117423/biohelpers_python.gitcd biohelpers_pythonpip install -e . or: 1pip install biohelpers D
间作系统中的抗性诱导
文献信息原文链接 研究背景增加栽培系统中的生物多样性能够有效促进农业的可持续发展。间作是增加农田生物多样性的有效手段。间作系统中的植物-植物互作是影响间作系统整体抗性的关键部分（下图）。在植物-植物间作系统中存在多种信号及其传播途径： 地上部分的挥发物性有机化合物：通过空气传播。 地下部分的根系分泌物：植物-植物间直接作用，或者是通过微生物等实现间接作用。 提出科学问题间作系统中的植株受到
gff文件缺少gene特征
1awk -F"[\t=]" 'BEGIN{OFS="\t"}{if($3=="mRNA"){print $1,$2,"gene",$4,$5,$6,$7,$8,$9"="$10 ; print $1,$2,$3,$4,$5,$6,$7,$8,$9"="$10"Parent="$10;}else{print $0}}' all.gff3 > all.gff3.new 复制粘贴使用： 1aw
qPCR:从样品采集到表达量计算
参考文献 Taylor S C, Nadeau K, Abbasi M, et al. The ultimate qPCR experiment: producing publication quality, reproducible data the first time[J]. Trends in Biotechnology, 2019, 37(7): 761-774. 采样计划 有多少个处
html学习笔记
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NCBI-NT库本地化构建流程
数据库下载https://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/ ascp（conda安装即可）高速下载链接： 1ascp -v -k 1 -T -l 1000m -i /home/xxxxx/miniconda3/envs/bioinfTools/etc/asperaweb_id_dsa.openssh anonftp@ftp.ncbi.nih.gov:/blast/db/nt.0