WSL设置内存和线程数 从这里开始写正文 Windows + R 键,输入 %UserProfile% 并运行进入用户文件夹; 新建一个 {% label .wslconfig purple %} 文件,写入下面的内容: 1234[wsl2]memory=30Gswap=12Gprocessors=12 先关闭WSL: 1wsl --shutdown 再开启即可: 1wsl 💌lixiang117423 2021-11-25
Ubuntu部署bookdown 安装Nginx: 1sudo apt-get install nginx 找个位置存放{% label bookdown purple %}编译好的文件夹,里面包含了整个的静态文件,如我的是{% label book4xiang purple %}。 修改配置文件: 12345678910111213cd /etc/nginx/conf.d/# 创建一个bookdown.conf,输入 2021-11-24 生物信息学 #生物信息学 #R #Nginx #Ubuntu #bookdown
Nginx端口转发实现80端口访问shiny-server 在{% label /etc/nginx/sites-enabled/ purple %}下的{% label default purple %}文件种添加如下内容: 1234567891011server { server_name www.test.com # 你的shiny的域名 listen 80; location / { proxy_pass htt 2021-11-24 生物信息学 #R #Shiny #Nginx #端口转发
转录组Htseq流程 12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243444546474849505152535455565758596061626364656667686970717273747576777879808182838485868788899091929394959697989910010110210 2021-11-23 生物信息学 #生物信息学 #软件使用 #RNA-Seq #Htseq
转录组Ballgown流程 前处理: gff转换成gtf: 1gffread Oryza_sativa.IRGSP-1.0.51.gff3 -T -o rice.gtf 提取外显子和可变剪切: 123hisat2_extract_exons.py IRGSP-1.0_representative_transcript_exon_2021-05-10.gtf >IRGSP-1.0.exon hisat2_extract 2021-11-23 生物信息学 #生物信息学 #软件安装 #RNA-Seq
Ubuntu安装Aspera 1234567891011wget https://ak-delivery04-mul.dhe.ibm.com/sar/CMA/OSA/09cne/0/ibm-aspera-connect-3.11.0.5-linux-g2.12-64.tar.gztar -zxvf ibm-aspera-connect-3.11.0.5-linux-g2.12-64.tar.gz./ibm-aspera-con 2021-11-23 生物信息学 #生物信息学 #软件安装
钙离子介导的水稻免疫机制 这是一篇让人读完以后叹为观止的文章,精彩,实在是精彩! 故事是这样开始的,在TP309(粳稻)育种群体中,发现一个很特殊的变种,这个变种携带了一个叫做rod1的基因,这个基因有什么特别的地方呢?通过田间试验和室内试验发现,携带了rod1基因的植株对水稻纹枯病、水稻稻瘟病和水稻白叶枯病这三种严重影响水稻生产的病害都具有广谱抗性(下图ABC);而且,其植株体内的SA和JA的含量也比TP309的高很多 2021-11-23 文献 #文献
Ubuntu部署Hexo 123456789101112131415161718192021222324252627282930313233# 添加用户adduser hexo# 切回用户目录su hexo# 新建目录存放blogmkdir blog# 初始化裸gitgit init --bare hexo.git# vim hexo.git/hooks/post-receive#!/bin/shgit --work-tr 2021-11-23
NCBI-blast-本地比对 安装 Blast +将下载的安装包解压缩后安装对应的.exe文件即可,安装完成后将安装目录下的bin文件夹的路径添加到环境变量中的Path中。 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/ 构建比对数据库可以利用自带的函数下载数据库: 1nohup perl update_blastdb.pl --decompress nt &> update.log & 2021-11-23
重测序分析脚本 重测序与群体遗传学 云南农业大学 云南生物资源保护与利用国家重点实验室 (李详 2019年12月31日) 软件安装该部分软件很难用conda直接安装,安装步骤比较特殊。 2021-11-23 生物信息学 - 群体遗传学 - Linux #生物信息学 #Linux