序列转换成fasta文件及后续的SwissProt数据库爬虫代码。

基因家族分析是一种常见的生物信息学分析套路，也是生物信息学数据挖掘发表小文章常用的分析方法，和GEO挖掘等类似。基因家族的分析鉴定可以用pfam上的hmm文件进行基因家族的检索鉴定，也可以用blast的方法进行比对鉴定，通常是适用拟南芥对应的基因家族进行比对鉴定。植物转录因子数据库，点击访问。 基因家族分析思路及文章撰写思路基因家族分析是继GEO数据挖掘后，一种新的生物信息学挖掘策略。 如何做基因

文献信息 Multi-omics analysis reveals the molecular mechanisms underlying virulence in Rhizoctonia and jasmonic acid–mediated resistance in Tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum) 研究背景 立枯丝核菌（Rhizoctonia

如果在运行hexo init和npm install报错的话，用 Node.js 自带的 Node.js command prompt 执行这两个命令就行了。 在cmd命令行中且切换目录：cd /d d:

点击下载软件压缩包 解压后进入到目录，运行： 1make 如果报错g++: fatal error: 已终止 signal terminated program cc1plus，那就需要修改虚拟内存大小，参考文章https://blog.web4xiang.top/posts/ubuntumemary/。 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gm

分析策略以下三个图来自微信公众号[希研未来]。 基于reads 基于组装 基于Bin 软件安装常用的这些软件用Conda或者是mamba都很好处理，但是metaWRAP这个软件是真的难安装啊。踩坑多次终于安装上了： 1mamba create -y --name metawrap-env --channel ursky metawrap-mg=1.3.2 数据配置Che

安装Rcpp报错installation of package ‘Rcpp’ had non-zero exit status： 在R的安装目录下启动这个软件： 输入代码： 1install.packages("Rcpp") 提示 Do you want to install from sources the package which needs compilation? (Yes/no/

堆积柱状图加上连接线能够更好地看出变化情况，参照“宏基因组”的教程改写了代码，封装成了一个函数。

更新版本: 推荐的资料 https://bookdown.org/roback/bookdown-BeyondMLR/ch-GLMM.html https://m-clark.github.io/mixed-models-with-R/ 文献信息 Harrison X A, Donaldson L, Correa-Cano M E, et al. A brief introduction to

第一章：导论 定量变量可以叫做协变量，定性变量叫做因子。 因子需要进行数字化编码才能用在统计模型中，转换后叫做伪变量。 因子有n个水平时，伪变量至少需要n-1个。 合适的模型的标准：简单和准确。 第二章：线性回归模型简介与回顾 线性回归模型是广义线性模型的一种特殊形式。 线性回归模型的定义 \begin{cases} var[y_i] = \frac{\sigma^2}{w_i}\\ \mu_

R最强大的莫过于统计分析和可视化，关键是完全的开源免费啊。有时候使用多了以后，会积累一些函数或者是数据库，而这些函数和数据库通常能够帮助到别人，这时候就可以把这些函数或者是数据库打包成R包，上传到CRAN、Bioconductor或者是GitHub，让 其他的使用者使用自己的包。

看到这篇文章： 参考文献： Hickey G, Monlong J, Ebler J, et al. Pangenome graph construction from genome alignments with Minigraph-Cactus[J]. Nature Biotechnology, 2023: 1-11. 官方推荐使用docker安装，可是真的不想在实验室服务器上安装doc