广义线性混合模型操作指南
更新版本: 推荐的资料 https://bookdown.org/roback/bookdown-BeyondMLR/ch-GLMM.html https://m-clark.github.io/mixed-models-with-R/ 文献信息 Harrison X A, Donaldson L, Correa-Cano M E, et al. A brief introduction to
CSS基础学习
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R语言常用Tips
经常要用到R，有些小技巧每次都要去查，比较麻烦，干脆记录一下。 软件安装 安装Rtools： 安装 Rtools4.0，安装包：https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/ 配置环境 在 RStudio 里面运行以下脚本： 1writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con
Windows下使用Aspera上传数据到NCBI
1C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin> .\ascp.exe -i .\temp\chhf.openssh -QT -l1000m -k1 -d 'F:\Raw Data\Figure 6 Raw data for RNA-seq\RNA-seq raw data\Os75a-1r
我的生物信息学知识合集
写在前面趁着这次培训，把学的东西都整理一下。不断更新，想到啥更新啥。。。。。。 软件推荐 ssh工具：目前在用的是Tabby，比较满意的是在一个窗口就可以实现ssh+文件的上传下载。 markdown工具：现在在用的是Typora，付费版本。 代码编辑工具： R：RStudio 其他：VS Code 软件安装VScode使用VScode主要是为了方便远程连接服务器进行远程开发。体验了几次，
统计建模学习笔记
统计建模什么是统计模型所有的假设统计检验和参数的统计估计都来源于统计模型。那么，什么是统计模型呢？可以将统计模型简单理解为一个数学等式。 概率的类型基本上可以分为两类： aleatory probability：可以理解为客观的概率，不受人为影响，如骰子出现的数字； epistemic probability：主观概率，比如提前知道骰子被动了手脚，那么每个数字出现的概率就不相等了。 概率和统计
Windows下Git-bash配置zsh主题
下载zsh安装包https://packages.msys2.org/package/zsh?repo=msys&variant=x86_64 将下载的文件解压后放到Git-bash的安装目录下，如C:\Program Files\Git\git-bash.exe。 在.bashrc文件中加入代码： 123if [ -t 1 ]; then exec zshfi 然后再终端输入zsh即
macBook安装igraph的崎岖之路
先是疯狂报错： 1234567891011121314151617181920212223242526......installing to /opt/homebrew/lib/R/4.5/site-library/00LOCK-igraph/00new/igraph/libs** R** demo** inst** byte-compile and prepare package for laz
用gffread从基因组提取序列
软件地址：https://github.com/gpertea/gffread 提取转录本序列 1gffread YLG.gff3 -g YLG.sort.fasta -w ylg.trans.fa 提取CDS序列 1gffread YLG.gff3 -g YLG.sort.fasta -x ylg.cds.fa 提取蛋白序列 1gffread YLG.gff3 -g YLG.sort