小蓝哥的知识荒原
  • 首页
  • 归档
  • 分类
  • 标签
  • 关于

pip加速

1-i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
2022-01-19
生物信息学
#生物信息学 #Python

python传参示例

12345678910111213141516171819202122232425262728293031323334353637383940414243import osimport reimport argparseparser = argparse.ArgumentParser(description="You should add those parameters")parser.add_
2022-03-24
生物信息学
#生物信息学

qPCR:从样品采集到表达量计算

参考文献 Taylor S C, Nadeau K, Abbasi M, et al. The ultimate qPCR experiment: producing publication quality, reproducible data the first time[J]. Trends in Biotechnology, 2019, 37(7): 761-774. 采样计划 有多少个处
2022-10-24
生物信息学
#生物信息学

qPCR注意事项

参考文献: Bustin S A, Beaulieu J F, Huggett J, et al. MIQE precis: Practical implementation of minimum standard guidelines for fluorescence-based quantitative real-time PCR experiments[J]. 2010. 💌lixi
2021-11-27
分子生物学
#生物信息学 #分子生物学 #qPCR

shell终端美化配置

安装官方版本 1234567891011wget https://raw.githubusercontent.com/ohmyzsh/ohmyzsh/master/tools/install.sh sh install.shsudo apt install powerline fonts-powerline #安装字体sudo apt install zsh-syntax-highlighti
2022-01-02
生物信息学
#生物信息学 #shell

shiny4qPCR-qPCR数据处理一站式解决方案

为什么做shiny4qPCRqPCR是现代分子生物学基础,其基本过程涉及引物设计、RNA(DNA)提取、qPCR实验、qPCR数据处理等。从研究生阶段到现在的博士阶段,我需要做大量的qPCR实验,每次数据处理都比较麻烦,虽然已经基本实现流程化了,但还是比较麻烦,因此,以RStudio的shiny-server为基础,写了个shiny app,专门用于处理qPCR相关数据。 注:目前软件源代码尚未
2021-12-04
分子生物学
#生物信息学 #分子生物学 #qPCR #shiny4qPCR

shiny上传文件报错

搭建shiny上传文件报错<html> <head><title>413 Request。奇怪的是大于1M的无法上传,小于1M的可以上传。一番检索发现是Nginx的问题。 shiny如果是用Nginx做的http代理和端口转发,那么Nginx默认可以上传文件大小是1M,需要修改Nginx的配置,在配置文件的http模块里面加入下面的代码: 12# set cli
2022-03-03
生物信息学
#生物信息学 #R

tidyHeatmap学习笔记

相当惊艳的一个包,简单学习了下。
2021-02-04
R语言
#R语言

wiki.js部署

安装PostgreSQL1234567891011121314151617181920212223242526sudo apt update && sudo apt upgradesudo apt-cache search postgresql | grep postgresqlsudo sh -c 'echo "deb http://apt.postgresql.org/pub/
2022-11-21
生物信息学
#生物信息学

不同数量样品绘制柱状图

昨天帮同学画图的实现不同样品数量的分组画柱状图会出问题:
2020-12-19
R语言
#R语言

不同栽培地点柳枝稷根际微生物群落的遗传决定因素

文献信息 Edwards J A, Saran U B, Bonnette J, et al. Genetic determinants of switchgrass-root-associated microbiota in field sites spanning its natural range[J]. Current Biology, 2023.00398-6?_returnURL=ht
2023-05-06
文献阅读
#文献阅读

从bam文件中提取比对上与否的序列

123samtools view -f 4 file.bam > unmapped.samsamtools view -b -f 4 file.bam > unmapped.bamsamtools view -b -F 4 file.bam > mapped.bam 1samtools view x.bam | awk '$3=="*" {print ">"$1"\n"$1
2021-12-29
生物信息学
#生物信息学
1…1415161718…26

搜索

Hexo Fluid
滇ICP备2021000708号-4