Ubuntu配置zsh和主题 总代码1234sudo apt-get updatesudo apt install zshchsh -s /bin/zshsh -c "$(curl -fsSL https://gitee.com/Devkings/oh_my_zsh_install/raw/master/install.sh)" 安装zsh12sudo apt install zshchsh -s /bin/zsh 安装Oh 2023-03-09 生物信息学 #生物信息学
VSCode取消波浪线 取消前是这样的(强迫症患者表示受不了啊。。。。。。): 取消方法: 在设置文件settings.json文件中加入下面的内容即可: 12345"workbench.colorCustomizations": { "editorError.foreground": "#00000000", "editorWarning.foreground": "#00000000 2023-04-05 生物信息学 #软件使用
UniProt数据库爬虫获取相关信息 最近在分析转录组,基因组是自己组装的,好多基因注释不到KEGG和GO这两个数据库,就索性先把基因蛋白blast到SwissProt数据库,然后得到比对的蛋白的ID,再经过筛选后再去看蛋白相关的GO term。但是,这么多基因我也不可能一个一个查啊,那就Python爬虫吧。 2021-04-18 Python #Python
VScode远程连接服务器并使用R 实验室服务器重装系统后RStudio无法登录,没法解决,索性使用VScode解决。 服务器端使用mamba管理R包。只需要安装如下几个包即可: 1234mamba create --name r # 新建环境mamba install -c conda-forge r-base # 安装Rmamba install -c conda-forge r-languageserver # 安装langu 2023-03-13 生物信息学 #生物信息学
WSL安装运行docker Docker的安装参考的安装教程:Docker-从入门到实践。关键的代码如下: 1234curl -fsSL test.docker.com -o get-docker.shcurl -fsSL get.docker.com -o get-docker.shsudo sh get-docker.sh --mirror Aliyunsudo sh get-docker.sh --mirror Azu 2021-12-06 生物信息学 #生物信息学 #软件安装 #WSL #docker
WSL设置内存和线程数 从这里开始写正文 Windows + R 键,输入 %UserProfile% 并运行进入用户文件夹; 新建一个 {% label .wslconfig purple %} 文件,写入下面的内容: 1234[wsl2]memory=30Gswap=12Gprocessors=12 先关闭WSL: 1wsl --shutdown 再开启即可: 1wsl 💌lixiang117423 2021-11-25
Windows下使用Aspera上传数据到NCBI 1C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin> .\ascp.exe -i .\temp\chhf.openssh -QT -l1000m -k1 -d 'F:\Raw Data\Figure 6 Raw data for RNA-seq\RNA-seq raw data\Os75a-1r 2022-03-25 生物信息学 #生物信息学
Windows下Git-bash配置zsh主题 下载zsh安装包https://packages.msys2.org/package/zsh?repo=msys&variant=x86_64 将下载的文件解压后放到Git-bash的安装目录下,如C:\Program Files\Git\git-bash.exe。 在.bashrc文件中加入代码: 123if [ -t 1 ]; then exec zshfi 然后再终端输入zsh即 2023-05-11 生物信息学 #生物信息学
Word交叉引用设置颜色为蓝色 参考知乎文章。 编辑一个新的宏: 12345678Sub CitingColor() For i = 1 To ActiveDocument.Fields.Count '遍历文档所有域 If Left(ActiveDocument.Fields(i).Code, 4) = " REF" Or Left(ActiveDocument.Fields(i).Code, 14) = " 2023-09-11 文献阅读 #文献阅读
Zotero删除重复文献条目 在左侧的{% label 重复条目 purple %}里面选中所有重复的文献条目,以此点击Tools-Developer-Run JavaScript,复制粘贴下方的代码运行: 123456var DupPane = Zotero.getZoteroPanes();for(var i = 0; i < 1000; i++) {await new Promise(r => setTime 2021-12-09 文献阅读 #文献阅读
pfastq-dump使用 软件地址 1https://github.com/inutano/pfastq-dump 批量处理 1for i in SRR*; do pfastq-dump -t 50 -s $i -O fastq/; done 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-01-11 生物信息学 #生物信息学 #软件使用 #pfastq-dump