qPCR注意事项
参考文献： Bustin S A, Beaulieu J F, Huggett J, et al. MIQE precis: Practical implementation of minimum standard guidelines for fluorescence-based quantitative real-time PCR experiments[J]. 2010. 💌lixi
shell终端美化配置
安装官方版本 1234567891011wget https://raw.githubusercontent.com/ohmyzsh/ohmyzsh/master/tools/install.sh sh install.shsudo apt install powerline fonts-powerline #安装字体sudo apt install zsh-syntax-highlighti
shiny上传文件报错
搭建shiny上传文件报错<html> <head><title>413 Request。奇怪的是大于1M的无法上传，小于1M的可以上传。一番检索发现是Nginx的问题。 shiny如果是用Nginx做的http代理和端口转发，那么Nginx默认可以上传文件大小是1M，需要修改Nginx的配置，在配置文件的http模块里面加入下面的代码： 12# set cli
shiny4qPCR-qPCR数据处理一站式解决方案
为什么做shiny4qPCRqPCR是现代分子生物学基础，其基本过程涉及引物设计、RNA（DNA）提取、qPCR实验、qPCR数据处理等。从研究生阶段到现在的博士阶段，我需要做大量的qPCR实验，每次数据处理都比较麻烦，虽然已经基本实现流程化了，但还是比较麻烦，因此，以RStudio的shiny-server为基础，写了个shiny app，专门用于处理qPCR相关数据。 注：目前软件源代码尚未
wiki.js部署
安装PostgreSQL1234567891011121314151617181920212223242526sudo apt update && sudo apt upgradesudo apt-cache search postgresql | grep postgresqlsudo sh -c 'echo "deb http://apt.postgresql.org/pub/
不同栽培地点柳枝稷根际微生物群落的遗传决定因素
文献信息 Edwards J A, Saran U B, Bonnette J, et al. Genetic determinants of switchgrass-root-associated microbiota in field sites spanning its natural range[J]. Current Biology, 2023.00398-6?_returnURL=ht
从bam文件中提取比对上与否的序列
123samtools view -f 4 file.bam > unmapped.samsamtools view -b -f 4 file.bam > unmapped.bamsamtools view -b -F 4 file.bam > mapped.bam 1samtools view x.bam | awk '$3=="*" {print ">"$1"\n"$1
从gff3文件提取基因长度
123456library(GenomicFeatures)txdb <- makeTxDbFromGFF("../genome/me.gff3",format="auto")exons_gene <- exonsBy(txdb, by = "gene")exons_gene_lens <- lapply(exons_gene,function(x){sum(width(redu