韦恩图
在R语言中绘制韦恩图通常有两种方法，小于5个集合的用R包VennDiagram即可完成绘制；超过5个的使用R包UpSetR进行绘制。 VennDiagram12345678910111213141516171819202122232425262728rm(list = ls())data.test = data.frame(A = rep(c('a','b','c'),c(10,23,17)),
pip加速
1-i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
KEGGREST用法
12library(KEGGREST) kegg <- keggGet("ko01120") 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
Docker部署nextcloud修改配置文件
找到对应的文件修改即可： 1find /var -name "config.php" 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
Ubuntu安装rJava
1234sudo apt-get install -y default-jresudo apt-get install -y default-jdksudo R CMD javareconfinstall.packages("rJava") 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
记录转录组遇到的一个坑
跑水稻的转录组，96个样品。 前面的所有流程都没有问题，跑到Counts计数的时候，全部都是0！！！不管是HtSeq还是FeatureCounts，计算出来全部都是0。然后我重新下载了别的参考基因组和注释信息，跑出来完全没有问题。一直不知道是哪里出现了问题。我也忘记是怎么排查的了，发现基因组染色体的名称和gtf文件里面的不一样： 基因组文件的染色体编号： 123456789101112>
Ubuntu将home目录挂载到新硬盘上
创建硬盘分区：按提示操作即可（容量大于2T的硬盘用parted命令） 12sudo parted /dev/sdb# 需要改成gtp格式的分区 创建文件系统 1mkfs.ext4 /dev/sdb1 查看UUID 1blkid 同步保存原来/home目录下的所有文件 12sudo mount /dev/sdb1 /mnt/old.home.220111sudo rsync -avx
pfastq-dump使用
软件地址 1https://github.com/inutano/pfastq-dump 批量处理 1for i in SRR*; do pfastq-dump -t 50 -s $i -O fastq/; done 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
小蓝哥的生信专刊
LinuxR软件安装 Ubuntu安装gdtools报错fatal error: cairo-ft.h 1sudo apt install libcairo2-dev PythonOther 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com