安装MCScanX 点击下载软件压缩包 解压后进入到目录,运行: 1make 如果报错g++: fatal error: 已终止 signal terminated program cc1plus,那就需要修改虚拟内存大小,参考文章https://blog.web4xiang.top/posts/ubuntumemary/。 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gm 2022-03-19 生物信息学 #生物信息学
Ubuntu修改虚拟内存大小 123456mkdir /swapcd /swapsudo dd if=/dev/zero of=swapfile bs=1024M count=10mkswap swapfileswapon swapfileswapoff swapfile 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-03-19 生物信息学 #生物信息学
hexo新文章无法更新显示问题的解决办法 千万不要把.deploy_git这个文件夹给隐藏了😂 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-03-18 软件使用 #软件使用
间作系统中的抗性诱导 文献信息原文链接 研究背景增加栽培系统中的生物多样性能够有效促进农业的可持续发展。间作是增加农田生物多样性的有效手段。间作系统中的植物-植物互作是影响间作系统整体抗性的关键部分(下图)。在植物-植物间作系统中存在多种信号及其传播途径: 地上部分的挥发物性有机化合物:通过空气传播。 地下部分的根系分泌物:植物-植物间直接作用,或者是通过微生物等实现间接作用。 提出科学问题间作系统中的植株受到 2022-03-17 文献阅读 #文献阅读
安装Rcpp报错解决方法 安装Rcpp报错installation of package ‘Rcpp’ had non-zero exit status: 在R的安装目录下启动这个软件: 输入代码: 1install.packages("Rcpp") 提示 Do you want to install from sources the package which needs compilation? (Yes/no/ 2022-03-16 生物信息学 #生物信息学
conda安装Bioperl 12345678910111213141516# 创建环境conda create -n bioperlconda activate bioperlconda install -c bioconda perl-bioperl# 查找Bioperl位置find anaconda3/* -name "Seq.pm"# 输出/home/lixiang/miniconda3/envs/bioperl/li 2022-03-11 生物信息学 #生物信息学
shiny上传文件报错 搭建shiny上传文件报错<html> <head><title>413 Request。奇怪的是大于1M的无法上传,小于1M的可以上传。一番检索发现是Nginx的问题。 shiny如果是用Nginx做的http代理和端口转发,那么Nginx默认可以上传文件大小是1M,需要修改Nginx的配置,在配置文件的http模块里面加入下面的代码: 12# set cli 2022-03-03 生物信息学 #生物信息学 #R
LeAFtool计算病斑面积 网页版地址: https://shiny.web4xiang.top/LeAFtool/ 分析流程数据准备将图片存储在三个文件夹内,压缩成.zip后上传就能进行分析: learning:存放用于训练的图片(直接截图即可),包括三个子文件夹: background:背景图片。如叶片是贴在A4纸上的,那么背景就截图A4纸。 limb:没有被病原菌侵染的健康叶片。 lesion:病斑截图。 res 2022-02-26 生物信息学 #生物信息学 #软件使用
服务器部署为知笔记 先安装Docker。 从Docker Hub下载为知笔记的最新镜像 1docker pull wiznote/wizserver 创建文件存放位置 1mkdir wizdata 启动为知笔记镜像 1docker run --name wiz --restart=always -it -d -v ~/wizdata:/wiz/storage -v /etc/localtime:/et 2022-02-20 软件使用 #生物信息学 #软件使用
数据分析技巧总结 根据进化树的距离挖掘新的抗性基因:OsWRKY71, a rice transcription factor, is involved in rice defense response - ScienceDirect PLS-DA用于微生物组数据分析:Frontiers | Comparison of the Ocular Microbiomes of Dry Eye Patients With 2022-02-03 生物信息学 #生物信息学 #文献
Ubuntu安装R包proj4 12sudo apt install libproj-dev libgdal-devinstall.packages("proj4", dependencies=TRUE) 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com 2022-02-03 生物信息学 #生物信息学 #R