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Ubuntu安装R包proj4

12sudo apt install libproj-dev libgdal-devinstall.packages("proj4", dependencies=TRUE) 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
2022-02-03
生物信息学
#生物信息学 #R

小蓝哥的生信专刊

LinuxR软件安装 Ubuntu安装gdtools报错fatal error: cairo-ft.h 1sudo apt install libcairo2-dev PythonOther 💌lixiang117423@foxmail.com💌lixiang117423@gmail.com
2022-01-08
生物信息学
#生物信息学

Tools4You教程2:相关性分析

相关性分析是一种常见的数据分析方法。本教程演示如何利用Tools4You来完成相关性分析。
2021-01-18
Tools4You
#Tools4You

blogdown部署到云服务器

部署到服务器服务器端服务器端主要是构建目录接受和存放博客内容。 eval1234567mkdir myblogcd mybloggit init --bare myblog.gitvi myblog.git/hooks/post-receive## 输入下面一行内容,目录换成自己的git --work-tree=/home/hexo/blog --git-dir=/home/hexo/hexo.g
2022-11-05
生物信息学
#生物信息学

VScode远程连接服务器并使用R

实验室服务器重装系统后RStudio无法登录,没法解决,索性使用VScode解决。 服务器端使用mamba管理R包。只需要安装如下几个包即可: 1234mamba create --name r # 新建环境mamba install -c conda-forge r-base # 安装Rmamba install -c conda-forge r-languageserver # 安装langu
2023-03-13
生物信息学
#生物信息学

服务器部署为知笔记

先安装Docker。 从Docker Hub下载为知笔记的最新镜像 1docker pull wiznote/wizserver 创建文件存放位置 1mkdir wizdata 启动为知笔记镜像 1docker run --name wiz --restart=always -it -d -v ~/wizdata:/wiz/storage -v /etc/localtime:/et
2022-02-20
软件使用
#生物信息学 #软件使用

数据分析技巧总结

根据进化树的距离挖掘新的抗性基因:OsWRKY71, a rice transcription factor, is involved in rice defense response - ScienceDirect PLS-DA用于微生物组数据分析:Frontiers | Comparison of the Ocular Microbiomes of Dry Eye Patients With
2022-02-03
生物信息学
#生物信息学 #文献

泛基因组工具vg

vg:variation graph data structures, interchange formats, alignment, genotyping, and variant calling methods. 1 基础知识vg其实就是variation graph的缩写:),一个vg中有这些元素: 1.1 **Node**(节点) 定义:表示基因组中的一段序列片段,可以是: 核心基因(
2025-05-09
生物信息学
#生物信息学

稻壳酮(momilactones)在水稻化感中的角色

摘要来自众多国家的研究者们通过田间试验和室内实验证明了水稻是具有化感活性的,具有化感活性的水稻品种会向周围的环境中释放化感物质
2021-02-27
文献
#文献

Pan-基因家族鉴定方法

参考文献 Shang L, Li X, He H, et al. A super pan-genomic landscape of rice[J]. Cell Research, 2022: 1-19. 这篇文献中要鉴定的是pan-NLRome,使用的方法是: InterProscan软件注释,筛选阈值是E-value < 1e−4; NLR-Parser鉴定结构域; 上面两个结果交叉验
2022-09-30
生物信息学
#生物信息学

Zotero删除重复文献条目

在左侧的{% label 重复条目 purple %}里面选中所有重复的文献条目,以此点击Tools-Developer-Run JavaScript,复制粘贴下方的代码运行: 123456var DupPane = Zotero.getZoteroPanes();for(var i = 0; i < 1000; i++) {await new Promise(r => setTime
2021-12-09
文献阅读
#文献阅读

Tools4You教程4:PCA

PCA简介PCA(Principal Component Analysis,主成分分析)是常见的降维方法,在生命科学中应用广泛。
2021-01-28
Tools4You
#Tools4You
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