R语言学习资料推荐

如何快速学习

我个人觉得最好的学习方法是这样的：

• 夯实基础：先把基础打牢（建议学习路径部分）；
• 项目实战：从项目出发，比如我想做微生物组分析，那就去找一篇经典的文献，学习其中的代码，把每行代码的意思搞懂，弄清楚需要的数据类型和结构，自己做项目分析的时候直接套用即可。
• 先让代码无报错的跑起来，再完善代码的可读性。切记：我们的目的是完成数据分析和可视化，而不是写很好看的代码！！！

建议学习路径

1. R、RStudio安装
2. R包安装
3. 数据读入
4. 数据导出
5. 数据重塑
   1. 长变宽
   2. 宽变长
6. 基础绘图
   1. ggplot2即可，不用学base绘图
   2. 图片导出为PPT格式
7. 批量化处理
   1. for循环
8. 可重复分析

学完这些基本就能应对80%以上的分析任务了。

视频推荐

2018年我学的就是这个视屏，我也只推荐这个视屏作为R语言的快速入门视频：B站视频-R 语言入门与数据分析

书籍推荐

只推荐这么两本书：

• 《R 语言编程 — 基于 tidyverse》：R数据分析的最新书籍，也是我最推荐的书籍，尽量不要碰《R语言实战》这本书。
• R 语言数据可视化之美：专业图表绘制指南：几乎所有的数据可视化类型都有，有代码。

博客推荐

只推荐两个博客：

• 北京大学统计科学中心李东风老师R语言教程：https://www.math.pku.edu.cn/teachers/lidf/docs/Rbook/html/_Rbook/index.html
• 四川师范大学王敏杰老师R语言教程：https://bookdown.org/wangminjie/R4DS/author.html#author

公众号推荐

• YuLabSMU：顶级R语言开发大神Y叔公众号。
• 生信技能树：我愿称之为国内生信最佳推广小组。
• 生信媛：秀恩爱之余还不忘写代码的榜样。
• 果子学生信：export包就是果子老师拯救的。
• 红皇后学术：大量微生物相关的优秀内容。
• 宏基因组：刘永鑫老师的公众号，强推。
• 老俊俊的生信笔记：总是刷新认知的绘图大佬。
• R语言数据分析指南
• 生信菜鸟团
• 生信宝典
• 统计之都
• VisualHub：很少更新，一更新就是惊喜。
• 微生信生物：南京农大文涛老师公众号，微生物组宏基因组。
• 小白鱼的生统笔记：从原理到代码的标杆公众号。
• 庄闪闪的R语言手册

文献阅读

优秀的文献是会释放代码和数据的，比如水稻微生物组经典文献：

在材料与方法里面有这样一段话：

也就是说他们的分析代码和数据都是公开的，如果想实现类似的分析，那么参考他们的代码就可以：