我的生信之路
一直想写写自己的生信之路，一直耽误，一直没有完成，今天收完实验室，晚上写写这个，就当放松了。
我的生信水平
按照行业的说法，我现在的水平就是Level 0。简单来说就是跑流程。转录组、微生物组、代谢组啥的都能跑跑流程。
初识生信
那是我刚刚本科毕业的时候，2018年7月的时候，由于考研考的本校，本科毕业就直接进实验室继续做实验学习。那时候我根本不知道什么是生物信息学，只是听导师偶尔提提。当时手里在做的项目是水稻的群体遗传学，肯定不会让我分析，我干的活是提DNA。大概是800+的DNA样品，工作就是种水稻，提DNA。假期的时候，导师让我去一个师兄的公司学习生物信息学，因为当时是想做那个水稻材料的GWAS，就想着让我去学GWAS。去的前几天，那个师兄让我安装个虚拟机，学学R和perl。然后就是折腾虚拟机的安装，那时候电脑性能一般，虚拟机卡的不行。也没学到个啥。大概是7月15号左右，就去师兄的公司了。去到公司，师兄把我交给另外一个工作人员，让我不懂的问他。那个工作人员随机给我开通了公司服务器的账号，可是我死活都连不上。快到中午的时候实在是没办法了，就请教那个兄弟，他问我连接的是不是公司的网络，我说不是，他告诉我要公司的网络才能连接上服务器。真的是太囧了嘞。师兄告诉我说不建议一上来就学GWAS，建议先从转录组开始。就让我自己从网上下载数据跑转录组流程。怎么说呢，那时候接触Linux不久，对命令行了解真的是小白水平，好多东西都无法解决。我忘不了成功下载NCBI原始数据的喜悦，真的是太开心了，也感叹公司的网络真好，下载速度那么快。然后是原始数据的质控，看到自己跑出来的质控结果，非常开心。最难的一步，是转录本定量吧，我一直没搞定，从网上看了好多方法都没有成功定量到counts值。直到我开学离开公司都没有完成这步。由于要开学，就先离开公司回学校了。这也算是我跟生信的初识吧。我一直记得那个园区的食堂是真的很难吃，每天下午下班我都会走路去吃一家重庆燃面，然后坐公交车回住的地方。郊区的公路是真的很灰，跑步都会搞得灰头土脸的那种。
R相伴
在整个过程中，不管是网上的教程还是公司的朋友们，都在说R语言。我压根不知道这东西能干啥。看了网上很多帖子都说R语言很重要，那就学习吧。不知道有多少人跟我一样学R是从《R语言实战2》开始的。首先，感谢这本书教会我R的基础；但是，这本书是真的写得一般。我还记得画个图要先各种设置画布，超级麻烦。直到后来学习ggplot2、tidyverse这些书籍，真的是大开眼界。在学习R以前，我的电脑里面装了各种破解软件，SPSS啊，origin lab啊啥的。现在的新电脑了没有这些软件了。学习R给我带来什么好处呢？
- 批量处理数据，解放自己。有个师姐要从一大个EXcel表格中筛选出每个采样点的采样数量，点鼠标好几天了还没有统计完，我说可以试试，写了个循环，
经验Tips
- 学会分享。三年前在简书的博客（https://www.jianshu.com/p/16d6c22ef71e）被阅读19k+次，其实整个就是我自己学了以后在简书上分享的，不知道我的这个文章帮助了多少人，我一定知道的是我被无数人的文章帮助过。感谢那些无私分享的人。
- 学会检索。一路学习过来，我觉得最重要的就是学会检索吧，现在不管遇到啥我都是先上谷歌搜索一番，通常都能找到答案的。
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