用gffread从基因组提取序列

软件地址：https://github.com/gpertea/gffread

• 提取转录本序列

gffread YLG.gff3 -g YLG.sort.fasta -w ylg.trans.fa

• 提取CDS序列

gffread YLG.gff3 -g YLG.sort.fasta -x ylg.cds.fa

• 提取蛋白序列

gffread YLG.gff3 -g YLG.sort.fasta -y ylg.protein.fa

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